RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 LRRK2Q5S007 2527 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJA2O60884 412 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 SERPINB7O75635 380 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 CLDN18P56856 261 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 QPRTQ15274 297 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 RABL3Q5HYI8 236 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 UBQLNLQ8IYU4 475 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF563Q8TA94 476 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ST8SIA1Q92185 356 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 COQ3Q9NZJ6 369 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 AP3M1Q9Y2T2 418 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 FAM215AQ9Y5M1 114 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 CDHR4A6H8M9 788 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 SHISA8B8ZZ34 492 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 EPPINO95925 133 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 FREM3P0C091 2139 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 PRKCAP17252 672 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ELK4P28324 431 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 RYKP34925 604 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 RAC1P63000 192 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 RTL6Q6ICC9 239 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 XKRXQ6PP77 449 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 FBXO27Q8NI29 283 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 SMPDL3BQ92485 455 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 KLHDC3Q9BQ90 382 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 RLIMQ9NVW2 624 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 CFAP73A6NFT4 308 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ADORA2A-AS1P86434 159 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 FOXF1Q12946 379 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF836Q6ZNA1 936 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 MRGPRGQ86SM5 289 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 PTOV1Q86YD1 416 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 LACC1Q8IV20 430 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 TRIB1Q96RU8 372 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 CALHM2Q9HA72 323 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-204ENST00000400919 MYO7BQ6PIF6 2116 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 PRORSD1PA6NEY8 169 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 CD8B2A6NJW9 211 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 GLI4P10075 376 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 AGAP20933 346 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 SLC25A53Q5H9E4 307 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 RPRMLQ8N4K4 120 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 MARVELD2Q8N4S9 558 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 POC1BQ8TC44 478 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 GJE1A6NN92 205 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 SEC14L5O43304 696 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 AQP1P29972 269 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 PRKAR1BP31321 381 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 NUDT2P50583 147 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 NUP107P57740 925 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 SESN3P58005 492 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 HACD2Q6Y1H2 254 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF550Q7Z398 422 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 ZZZ3Q8IYH5 903 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 TUBA1CQ9BQE3 449 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 SERINC1Q9NRX5 453 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 ACER3Q9NUN7 267 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 BAHCC1Q9P281 2608 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 GP1BBP13224 206 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 PCGF2P35227 344 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 CLDN20P56880 219 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 VMACQ2NL98 169 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 ERICH5Q6P6B1 374 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 LILRA2Q8N149 483 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 ASB5Q8WWX0 329 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 SLC35B4Q969S0 331 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 NPAS1Q99742 590 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 PIF1Q9H611 641 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 FAAHO00519 579 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 NDUFAB1O14561 156 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 NTN1O95631 604 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 RNF224P0DH78 156 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-204ENST00000400919 HTR3AP46098 478 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms