RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641815.1

STX3-208, Transcript of syntaxin 3, human

BASIC

Gene STX3, Length 3,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX3-208	ENST00000641815	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C12orf57	Q99622	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	EXD2	Q9NVH0	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	WNT9A	O14904	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HCN1	O60741	890 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SCG5	P05408	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RHO	P08100	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MSR1	P21757	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GADD45A	P24522	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MST1	P26927	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PGGT1B	P53609	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PDE7A	Q13946	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CARTPT	Q16568	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PCTP	Q9UKL6	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		A0A0U1RQS6	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	INSIG1	O15503	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	EFEMP2	O95967	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SEMG1	P04279	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LCK	P06239	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HBQ1	P09105	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NR2C1	P13056	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HSD11B1	P28845	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DCTD	P32321	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CAPZB	P47756	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RGS4	P49798	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GZMK	P49863	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MTPN	P58546	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NHLH1	Q02575	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR4D1	Q15615	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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