RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 LAT2Q9GZY6 243 aa14.72□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 MMP25Q9NPA2 562 aa14.72□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TCFL5Q9UL49 500 aa14.72□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.72□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.72□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OIP5O43482 229 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OR6B1O95007 311 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC159P0C7I6 412 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 GABRB1P18505 474 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 HLCSP50747 726 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 CTBP2P56545 445 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NRG3P56975 720 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 GABARAPL2P60520 117 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TUBA4AP68366 448 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 IL1RL1Q01638 556 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 CDK5R2Q13319 367 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 MRGPREQ86SM8 312 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 SLC15A4Q8N697 577 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 AMER2Q8N7J2 671 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TTC9Q92623 222 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ING2Q9H160 280 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 A0A0C4DFX4 3053 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 SDK2Q58EX2 2172 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 C21orf140B9A014 251 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TM4SF5O14894 197 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF264O43296 627 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 IGF2P01344 180 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 POU2F1P14859 743 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 CRHBPP24387 322 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 ELK4P28324 431 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 PRKCDQ05655 676 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 C12orf73Q69YU5 71 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 DESI1Q6ICB0 168 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 ULK3Q6PHR2 472 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 MISPQ8IVT2 679 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 NRMQ8IXM6 262 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM239Q8WW34 195 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 APH1BQ8WW43 257 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 C12orf10Q9HB07 376 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 MYOTQ9UBF9 498 aa14.7□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.061e-323■□□□□ 8.6
SNHG6-201ENST00000520348 NTN1O95631 604 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TFAP2AP05549 437 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 FBXO45P0C2W1 286 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 HPGDP15428 266 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 EVI2BP34910 448 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 STAT5AP42229 794 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 SLC6A8P48029 635 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 MEP1AQ16819 746 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 KIF18BQ86Y91 864 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 C3orf49Q96BT1 292 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 ARSGQ96EG1 525 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 RNF6Q9Y252 685 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.69□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 FRYLO94915 3013 aa14.68□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms