RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SNX32Q86XE0 403 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 RIMKLAQ8IXN7 391 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NATD1Q8N6N6 113 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 COQ8BQ96D53 544 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PERPQ96FX8 193 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SFXN2Q96NB2 322 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R10Q9NYW0 307 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FLRT3Q9NZU0 649 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CLCF1Q9UBD9 225 aa10.53□□□□□ -0.72
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PRAME-210ENST00000442481 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 RTTNQ86VV8 2226 aa10.53□□□□□ -0.72
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PRAME-210ENST00000442481 EXPH5Q8NEV8 1989 aa10.52□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PNV4 684 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 TTC36A6NLP5 189 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 C17orf51A8MQB3 221 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 INAFM1C9JVW0 142 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD28O15084 1053 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A2O15244 555 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 UTS2O95399 124 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 KCNJ5P48544 419 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN26Q16670 478 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 DUSP5Q16690 384 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 SPANXN4Q5MJ08 99 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 TEX37Q96LM6 180 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 FAM234BA2RU67 622 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A20A6NK97 555 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 C16orf97H3BN30 126 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 LINC01387J3KSC0 135 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 TNFSF13O75888 250 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 KRT34O76011 436 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 NKX2-2O95096 273 aa10.51□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 IL33O95760 270 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 IFNA2P01563 188 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1D-16P01601 117 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 PEPDP12955 493 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 COX4I1P13073 169 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 HPGDP15428 266 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 PPP3CBP16298 524 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1C1P21283 382 aa10.51□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 HBA1P69905 142 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 KRT72Q14CN4 511 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 GRAMD1BQ3KR37 738 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 TIGD2Q4W5G0 525 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 ANXA8L1Q5VT79 327 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 MARCH3Q86UD3 253 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 FUNDC1Q8IVP5 155 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 MEIOBQ8N635 442 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.51□□□□□ -0.73
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