RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IDS	B3KWA1	339 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CLDN4	O14493	209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	THBS1	P07996	1170 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	HTR1A	P08908	422 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CD63	P08962	238 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	STX4	Q12846	297 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SSPN	Q14714	243 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB39A	Q14964	217 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NEDD8	Q15843	81 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SGCD	Q92629	289 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NODAL	Q96S42	347 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	XPNPEP2	O43895	674 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR10H3	O60404	316 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ALOX12B	O75342	701 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	STX11	O75558	287 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	NKX2-2	O95096	273 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	HEXB	P07686	556 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	POU2F1	P14859	743 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	S1PR1	P21453	382 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CRISP1	P54107	249 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	EMP2	P54851	167 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DUSP8	Q13202	625 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TBR1	Q16650	682 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	APH1B	Q8WW43	257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	POLH	Q9Y253	713 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	KALRN	O60229	2985 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZAR1L	A6NP61	321 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM20B	O75063	409 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	GUSB	P08236	651 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	OSM	P13725	252 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MMP11	P24347	488 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	IFNA8	P32881	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	HSD17B7	P56937	341 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TAS2R41	P59536	307 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	BIK	Q13323	160 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TUBA3C	Q13748	450 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	XAF1	Q6GPH4	301 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25

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