RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PCSK5Q92824 1860 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 A6NL46 340 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 AP3D1O14617 1153 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 DPM1O60762 260 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 DNAJB5O75953 348 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PRKD3O94806 890 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ANGPTL1O95841 491 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FABP3P05413 133 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 C1QTNF9P0C862 333 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 UBL4AP11441 157 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CD247P20963 164 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ATP6V1B2P21281 511 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CNR1P21554 472 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CD96P40200 585 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CASP3P42574 277 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 MAP2K6P52564 334 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FBXW4P57775 412 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ARG2P78540 354 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 DMTNQ08495 405 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 RIPK1Q13546 671 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TUBA3CQ13748 450 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PRR22Q8IZ63 422 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ZNF614Q8N883 585 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TMEM234Q8WY98 164 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FRMD6Q96NE9 622 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ZNF559Q9BR84 538 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TRIM2Q9C040 744 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 USP22Q9UPT9 525 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 AP4S1Q9Y587 144 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 A0A087WZY1 265 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SLC25A12O75746 678 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 KRT36O76013 467 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 WDPCPO95876 746 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 THRBP10828 461 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 RHCEP18577 417 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 PGCP20142 388 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 MAGEA2P43356 314 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 HTR3AP46098 478 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 P2RX1P51575 399 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ARHGDIAP52565 204 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CBFBQ13951 182 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 CCNIQ14094 377 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 OR1C1Q15619 314 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 NRF1Q16656 503 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 DUSP7Q16829 419 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 VRK2Q86Y07 508 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 LINC00471Q8N535 108 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 SMYD1Q8NB12 490 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-220ENST00000550700 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.53□□□□□ -1.04
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