RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PPM1BO75688 479 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 NGFRP08138 427 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ITGA2P17301 1181 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ATP6V1C1P21283 382 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 LCN1P31025 176 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PTGDSP41222 190 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ID4P47928 161 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PNLIPRP2P54317 469 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GAS1P54826 345 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CDH12P55289 794 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SPIBQ01892 262 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 RTP5Q14D33 572 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 EXT1Q16394 746 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 BTBD16Q32M84 506 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OR52J3Q8NH60 311 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PSMF1Q92530 271 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TFAP2CQ92754 450 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 NACC2Q96BF6 587 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PRRC1Q96M27 445 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF570Q96NI8 536 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 MBOAT4Q96T53 435 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 FAM117AQ9C073 453 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.64□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SCN2AQ99250 2005 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 A0A1W2PRQ8 180 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ALG1L2C9J202 215 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GNGT2O14610 69 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 AP3D1O14617 1153 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ADAMDEC1O15204 470 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 FMO6PO60774 539 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 REM1O75628 298 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CYP7B1O75881 506 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 WISP1O95388 367 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SNAP29O95721 258 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 HPP00738 406 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 HPRP00739 348 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GASTP01350 101 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 FBXO45P0C2W1 286 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ITGAMP11215 1152 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 UQCRBP14927 111 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 NAGAP17050 411 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CBLP22681 906 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 MST1P26927 711 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CD82P27701 267 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OTX2P32243 289 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 FBXW4P57775 412 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CHAF1BQ13112 559 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SKP2Q13309 424 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 DGCR6Q14129 220 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GK3PQ14409 553 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OR1Q1Q15612 314 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 MICAQ29983 383 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SLC36A3Q495N2 470 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 COLEC12Q5KU26 742 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CBLN3Q6UW01 205 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 USP51Q70EK9 711 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 MRGPREQ86SM8 312 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CMIPQ8IY22 773 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SLC5A8Q8N695 610 aa8.63□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms