RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531036.2

RBM4B-206, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 2 BASIC

Gene RBM4B, Length 1,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-206	ENST00000531036	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	CD8B2	A6NJW9	211 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	CLCA1	A8K7I4	914 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	ALG1L2	C9J202	215 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036		H0YC42	278 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	NDUFB5	O43674	189 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	IL2RA	P01589	272 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	C1QC	P02747	245 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	ZNF708	P17019	499 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	IGFBP2	P18065	325 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	TBXA2R	P21731	343 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	CHM	P24386	653 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	IL12A	P29459	219 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	TIMP3	P35625	211 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	DGKQ	P52824	942 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	CD226	Q15762	336 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	NXN	Q6DKJ4	435 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	OGFOD2	Q6N063	350 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	SMPDL3B	Q92485	455 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	TESC	Q96BS2	214 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	MOAP1	Q96BY2	351 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	VDAC3	Q9Y277	283 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RBM4B-206	ENST00000531036	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036		H3BML4	177 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	OIP5	O43482	229 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	NGFR	P08138	427 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	HPGD	P15428	266 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	ATP6V1C1	P21283	382 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	MATN1	P21941	496 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	DLX5	P56178	289 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	CALHM2	Q9HA72	323 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036		E9PBE3	544 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	SCD	O00767	359 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	SEC14L5	O43304	696 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	KRT16	P08779	473 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	S100A3	P33764	101 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	CLDN15	P56746	228 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	CLDN20	P56880	219 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	FOXF2	Q12947	444 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	OR52B2	Q96RD2	323 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	HCFC1	P51610	2035 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	NOTCH2	Q04721	2471 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	ZNF195	O14628	629 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	DVL2	O14641	736 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	TGM6	O95932	706 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	LCN1	P31025	176 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	KRTAP10-9	P60411	292 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	ZNF614	Q8N883	585 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	INPP5K	Q9BT40	448 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	OR51I1	Q9H343	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	LRBA	P50851	2863 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036	APC	P25054	2843 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RBM4B-206	ENST00000531036		A0A1W2PQD3	144 aa		12.74	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms