RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 BPGMP07738 259 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 RIPPLY3P57055 190 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM27E3Q08E93 113 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 GUSBP1Q15486 140 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CCNJQ5T5M9 372 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 PAMR1Q6UXH9 720 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CHMP1BQ7LBR1 199 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 METTL25Q8N6Q8 603 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 GATSQ8NAP1 163 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 C1orf50Q9BV19 199 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 TMUB1Q9BVT8 246 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 RNF122Q9H9V4 155 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF175Q9Y473 711 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 AP4B1Q9Y6B7 739 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 DIO3P55073 304 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 OR2A2Q6IF42 318 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 SMPDL3BQ92485 455 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CAVIN3Q969G5 261 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 VDAC3Q9Y277 283 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 TESMINQ9Y4I5 508 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 NDUFB5O43674 189 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 AQP8O94778 261 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ALOX5P09917 674 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 DNASE1P24855 282 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 SERPINB5P36952 375 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 HPCAL1P37235 193 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 PON3Q15166 354 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 POU4F3Q15319 338 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 IL23RQ5VWK5 629 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 EMBQ6PCB8 327 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 HOMEZQ8IX15 550 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 PSMA8Q8TAA3 256 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 PGM2Q96G03 612 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 A0A1W2PRB8 838 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM114B3SHH9 223 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ATE1O95260 518 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CPOXP36551 454 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC6A8P48029 635 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 SIRPAP78324 504 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CD226Q15762 336 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR93Q6P2C0 686 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 RIMKLAQ8IXN7 391 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 COX18Q8N8Q8 333 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 COQ8BQ96D53 544 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 MBD6Q96DN6 1003 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 BTBD2Q9BX70 525 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CXorf36Q9H7Y0 433 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNE3Q9Y6H6 103 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 SIAH2O43255 324 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 GOSR1O95249 250 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 MAPK1P28482 360 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CCKARP32238 428 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 PCYT1AP49585 367 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 OCRLQ01968 901 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 PLPPR5Q32ZL2 321 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 POC1BQ8TC44 478 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 CDS1Q92903 461 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGRG7Q96K78 797 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 UBQLN4Q9NRR5 601 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 DUSP22Q9NRW4 184 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 MED17Q9NVC6 651 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 GPATCH2Q9NW75 528 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIOBP-209ENST00000428075 ITM2AO43736 263 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF17P17021 662 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 LCN1P31025 176 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 PRIM2P49643 509 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 CPTPQ5TA50 214 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 FBXW10Q5XX13 1052 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 OR5P2Q8WZ92 322 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 JADE3Q92613 823 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.07■■□□□ 1.6
TRIOBP-209ENST00000428075 ALPK1Q96QP1 1244 aa25.07■■□□□ 1.6
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