RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	PTC5	Q12511	572 aa		4.46	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	FOB1	O13329	566 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	HCM1	P25364	564 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	TFC4	P33339	1025 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PEX6	P33760	1030 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	TFC3	P34111	1160 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	LST4	P34239	828 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	EXO84	P38261	753 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	RRI2	Q12348	645 aa		4.45	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	KOG1	P38873	1557 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	GAL10	P04397	699 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	SSH4	P32343	579 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PLC1	P32383	869 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	EUG1	P32474	517 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	BET3	P36149	193 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	YBR071W	P38243	211 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PIC2	P40035	300 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	HUL4	P40985	892 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PFD1	P46988	109 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	UBA2	P52488	636 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PIP2	P52960	996 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	ERP6	P53198	216 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	SUN4	P53616	420 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	UGO1	Q03327	502 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	TAF8	Q03750	510 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	RSM24	Q03976	319 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MRL1	Q06815	381 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	RXT3	Q07458	294 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	CDC6	P09119	513 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	SWI3	P32591	825 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	VBA5	P36172	582 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	JNM1	P36224	373 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	ALG3	P38179	458 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	GEM1	P39722	662 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	NDE1	P40215	560 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MAL11	P53048	616 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	YNL193W	P53870	558 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MET14	Q02196	202 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	TMA10	Q06177	86 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	NTO1	Q12311	748 aa		4.43	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	GAL1	P04385	528 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	TAF13	P11747	167 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	CMP2	P14747	604 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MEF1	P25039	761 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	MRP8	P35719	219 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	RFC5	P38251	354 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	IRR1	P40541	1150 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	TRE2	Q08693	809 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	GPB1	Q08886	897 aa		4.42	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	AGP1	P25376	633 aa		4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	DSS1	P39112	969 aa		4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	GDH3	P39708	457 aa		4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	ALR2	P43553	858 aa		4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	CTF4	Q01454	927 aa		4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.41	□□□□□ -1.7
DDP1	YOR163W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	CHS7	P38843	316 aa		4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	VPS62	P53285	467 aa		4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	SHE9	Q04172	456 aa		4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	MKK2	P32491	506 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	PTH2	P34222	208 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	YML131W	Q03102	365 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	GRC3	Q07845	632 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	PTP2	P29461	750 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	MUM2	P38236	366 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	PBY1	P38254	753 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	RIM4	P38741	713 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	MNT3	P40549	630 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	YFL054C	P43549	646 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	BNA1	P47096	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDP1	YOR163W	PHO23	P50947	330 aa		4.38	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 117.5 ms