RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636351.1

CLN3-247, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-247ENST00000636351 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
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CLN3-247ENST00000636351 PCNTO95613 3336 aa23■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 HOXB7P09629 217 aa22.98■■□□□ 1.27
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CLN3-247ENST00000636351 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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CLN3-247ENST00000636351 ZNF521Q96K83 1311 aa22.98■■□□□ 1.27
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CLN3-247ENST00000636351 ALDH1B1P30837 517 aa22.96■■□□□ 1.27
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CLN3-247ENST00000636351 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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CLN3-247ENST00000636351 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN3-247ENST00000636351 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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CLN3-247ENST00000636351 NYXQ9GZU5 481 aa22.94■■□□□ 1.26
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CLN3-247ENST00000636351 GPTP24298 496 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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CLN3-247ENST00000636351 TSPYL6Q8N831 410 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.92■■□□□ 1.26
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CLN3-247ENST00000636351 PASKQ96RG2 1323 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 PROSER3Q2NL68 480 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CLN3-247ENST00000636351 HACL1Q9UJ83 578 aa22.91■■□□□ 1.26
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CLN3-247ENST00000636351 CNTNAP1P78357 1384 aa22.87■■□□□ 1.25
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CLN3-247ENST00000636351 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.86■■□□□ 1.25
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CLN3-247ENST00000636351 HYPKQ9NX55 129 aa22.85■■□□□ 1.25
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CLN3-247ENST00000636351 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CLN3-247ENST00000636351 COPS6Q7L5N1 327 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN3-247ENST00000636351 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN3-247ENST00000636351 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.82■■□□□ 1.24
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