RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621161.4

RAB11FIP4-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 8,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AACSQ86V21 672 aa22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STX6O43752 255 aa22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GAS8O95995 478 aa22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STX1AQ16623 288 aa22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IFT74Q96LB3 600 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MCM5P33992 734 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 A0A1B0GUL7 405 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TUBB4BP68371 445 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 VCXQ9H320 206 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TMC6Q7Z403 805 aa22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 VPS52Q8N1B4 723 aa22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 C8orf76Q96K31 380 aa22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STRN4Q9NRL3 753 aa22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GBP1P32455 592 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CRCPO75575 148 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RUFY3Q7L099 469 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CAPN2P17655 700 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KANK3Q6NY19 840 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PCK1P35558 622 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TIAM1Q13009 1591 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GEN1Q17RS7 908 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LRRC43Q8N309 656 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CCDC89Q8N998 374 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KRT13P13646 458 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CALCOCO2Q13137 446 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CCDC7Q96M83 1385 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GNG11P61952 73 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SPAG5Q96R06 1193 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CA8P35219 290 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SYNJ1O43426 1573 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PIP4K2BP78356 416 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NEDD9Q14511 834 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CAVIN2O95810 425 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.215e-6■■■■□ 22
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTAGE9A4FU28 777 aa22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BICD1Q96G01 975 aa22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4-211ENST00000621161 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 WDR78Q5VTH9 848 aa22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IQCA1Q86XH1 822 aa22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CUL7Q14999 1698 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTAGE8P0CG41 777 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ATP5DP30049 168 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BANK1Q8NDB2 785 aa22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NCOA2Q15596 1464 aa22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PDE3AQ14432 1141 aa22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HMGXB3Q12766 1538 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms