RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 KRT24Q2M2I5 525 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF428Q96B54 188 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 SNED1Q8TER0 1413 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 ERBB4Q15303 1308 aa24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 TAF1P21675 1872 aa24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-210ENST00000595594 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.2■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.2■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 FZD9O00144 591 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 COPS6Q7L5N1 327 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 LDHDQ86WU2 507 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 HACL1Q9UJ83 578 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 LTBP1Q14766 1721 aa24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 PSMD1Q99460 953 aa24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 EPHX2P34913 555 aa24.17■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 PARP10Q53GL7 1025 aa24.17■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 JDP2Q8WYK2 163 aa24.17■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 NLRP3Q96P20 1036 aa24.16■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.16■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 CREBZFQ9NS37 354 aa24.16■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 RUNDC1Q96C34 613 aa24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 PASKQ96RG2 1323 aa24.14■■□□□ 1.46
FCHO1-210ENST00000595594 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 ABCC4O15439 1325 aa24.13■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 CHL1O00533 1208 aa24.13■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 NLRP10Q86W26 655 aa24.13■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 GPC2Q8N158 579 aa24.13■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 CAPN15O75808 1086 aa24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 AOC3Q16853 763 aa24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 PPIP5K2O43314 1243 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 TCIRG1Q13488 830 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 EPS15P42566 896 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 NIM1KQ8IY84 436 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 CNTNAP1P78357 1384 aa24.08■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.08■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 CNTROBQ8N137 903 aa24.08■■□□□ 1.45
FCHO1-210ENST00000595594 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 SCNN1DP51172 638 aa24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 TNS4Q8IZW8 715 aa24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.06■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.06■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 COL4A1P02462 1669 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 VEGFBP49765 207 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 MBIPQ9NS73 344 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.03■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 SP8Q8IXZ3 490 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 MPNDQ8N594 471 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 FAM89AQ96GI7 184 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-210ENST00000595594 CFAP44Q96MT7 982 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms