RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-226	ENST00000593200	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	GPC2	Q8N158	579 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	COL4A5	P29400	1685 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	GPT	P24298	496 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	NTSR2	O95665	410 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	FOXN1	O15353	648 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	VEGFB	P49765	207 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	SCNN1D	P51172	638 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	PDIA6	Q15084	440 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	LAMB2	P55268	1798 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	EPS15	P42566	896 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	RIPK4	P57078	832 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	ANXA1	P04083	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	ABCC4	O15439	1325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	AOC3	Q16853	763 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-226	ENST00000593200	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	LBX1	P52954	281 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25	5e-7	■■■□□ 18
EFTUD2-226	ENST00000593200	RALBP1	Q15311	655 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	BBOX1	O75936	387 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	CXCL9	Q07325	125 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	TAF1	P21675	1872 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	TRAF5	O00463	557 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	CST9	Q5W186	159 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-226	ENST00000593200	CHL1	O00533	1208 aa		13.48	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms