RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525506.1

RBBP4-216, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 2

Gene RBBP4, Length 501 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-216	ENST00000525506	GNAI1	P63096	354 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-216	ENST00000525506	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-216	ENST00000525506	IL16	Q14005	1332 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-216	ENST00000525506	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBBP4-216	ENST00000525506	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	POTEC	B2RU33	542 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	HTRA3	P83110	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	APLP1	P51693	650 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-216	ENST00000525506	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	FSTL1	Q12841	308 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	COL4A5	P29400	1685 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	ABCC4	O15439	1325 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	SCN4A	P35499	1836 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	PSMD1	Q99460	953 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	COL4A1	P02462	1669 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	FZD9	O00144	591 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	MYD88	Q99836	296 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	AOC3	Q16853	763 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBBP4-216	ENST00000525506	BBOX1	O75936	387 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBBP4-216	ENST00000525506	GRAP	Q13588	217 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBBP4-216	ENST00000525506	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBBP4-216	ENST00000525506	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBBP4-216	ENST00000525506	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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