RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521231.1

HOXA-AS3-204, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA-AS3, Length 621 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 LAMB2P55268 1798 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NTSR2O95665 410 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GPTP24298 496 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 HACL1Q9UJ83 578 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 LTBP1Q14766 1721 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EPHX2P34913 555 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GPC2Q8N158 579 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CNTNAP1P78357 1384 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RIPK4P57078 832 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SLC51AQ86UW1 340 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TNS4Q8IZW8 715 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PROSER3Q2NL68 480 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PARP10Q53GL7 1025 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 JDP2Q8WYK2 163 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TAF1P21675 1872 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RALBP1Q15311 655 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ANXA1P04083 346 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CNTROBQ8N137 903 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NLRP3Q96P20 1036 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 VEGFBP49765 207 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SCNN1DP51172 638 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 COPS6Q7L5N1 327 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 VPS33BQ9H267 617 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CHL1O00533 1208 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 FOXN1O15353 648 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NLRP10Q86W26 655 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ABCC4O15439 1325 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RASSF10A6NK89 507 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EPS15P42566 896 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TCIRG1Q13488 830 aa24■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 KRT24Q2M2I5 525 aa24■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CAPN15O75808 1086 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NECTIN2Q92692 538 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PPIP5K2O43314 1243 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BBOX1O75936 387 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 AOC3Q16853 763 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SP8Q8IXZ3 490 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NIM1KQ8IY84 436 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 WBP1LQ9NX94 342 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NEUROD2Q15784 382 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.95■■□□□ 1.43
HOXA-AS3-204ENST00000521231 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CXCL9Q07325 125 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RUNDC1Q96C34 613 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MPNDQ8N594 471 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXA-AS3-204ENST00000521231 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms