RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478037.1

REXO4-205, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, human

TSL 2

Gene REXO4, Length 847 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO4-205	ENST00000478037	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	PROSER3	Q2NL68	480 aa		33.42	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	PARP10	Q53GL7	1025 aa		33.42	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	JDP2	Q8WYK2	163 aa		33.42	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	PDIA6	Q15084	440 aa		33.41	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	LDHD	Q86WU2	507 aa		33.41	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	SCN4A	P35499	1836 aa		33.41	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		33.4	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	PSMD1	Q99460	953 aa		33.4	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	HACL1	Q9UJ83	578 aa		33.4	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		33.39	■■■□□ 2.94
REXO4-205	ENST00000478037	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		33.38	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		33.38	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	NLRP3	Q96P20	1036 aa		33.38	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		33.37	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		33.37	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	SNED1	Q8TER0	1413 aa		33.36	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	FZD9	O00144	591 aa		33.36	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	COPS6	Q7L5N1	327 aa		33.36	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	RUNDC1	Q96C34	613 aa		33.36	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	CREBZF	Q9NS37	354 aa		33.36	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	EPHX2	P34913	555 aa		33.35	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		33.35	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		33.35	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	KRT24	Q2M2I5	525 aa		33.34	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	SLC51A	Q86UW1	340 aa		33.34	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		33.34	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		33.33	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	GPC2	Q8N158	579 aa		33.33	■■■□□ 2.93
REXO4-205	ENST00000478037	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		33.32	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		33.32	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	COL4A5	P29400	1685 aa		33.29	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	CHL1	O00533	1208 aa		33.29	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	33.29	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		33.29	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	NLRP10	Q86W26	655 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	NIM1K	Q8IY84	436 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	ABCC4	O15439	1325 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	PASK	Q96RG2	1323 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	PPIP5K2	O43314	1243 aa		33.27	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		33.27	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.27	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
REXO4-205	ENST00000478037	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		33.26	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	TCIRG1	Q13488	830 aa		33.25	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		33.25	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	AOC3	Q16853	763 aa		33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	LAMB2	P55268	1798 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	TNS4	Q8IZW8	715 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	CNTNAP1	P78357	1384 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	CNTROB	Q8N137	903 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
REXO4-205	ENST00000478037	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	BBOX1	O75936	387 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	HOXB7	P09629	217 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	LTBP1	Q14766	1721 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	EPS15	P42566	896 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	SCNN1D	P51172	638 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	MPND	Q8N594	471 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	CAPN15	O75808	1086 aa		33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	GRAP	Q13588	217 aa		33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	SP8	Q8IXZ3	490 aa		33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.15	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		33.14	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	VPS33B	Q9H267	617 aa		33.14	■■■□□ 2.9
REXO4-205	ENST00000478037	HYPK	Q9NX55	129 aa		33.13	■■■□□ 2.89
REXO4-205	ENST00000478037	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		33.13	■■■□□ 2.89

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