RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475208.5

TMEM54-205, Transcript of transmembrane protein 54, human

TSL 1 (best)

Gene TMEM54, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM54-205	ENST00000475208	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	EPHX2	P34913	555 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	NTSR2	O95665	410 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	GPC2	Q8N158	579 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	CNTNAP1	P78357	1384 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	COL4A5	P29400	1685 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	CAPN15	O75808	1086 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TMEM54-205	ENST00000475208	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	RIPK4	P57078	832 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	PARP10	Q53GL7	1025 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	PDIA6	Q15084	440 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	ANXA1	P04083	346 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	RALBP1	Q15311	655 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	CNTROB	Q8N137	903 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
TMEM54-205	ENST00000475208	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	VEGFB	P49765	207 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	SCNN1D	P51172	638 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	FOXN1	O15353	648 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	ABCC4	O15439	1325 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TMEM54-205	ENST00000475208	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	EPS15	P42566	896 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	AOC3	Q16853	763 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	LAMB2	P55268	1798 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	RASSF10	A6NK89	507 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	AIDA	Q96BJ3	306 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	VPS33B	Q9H267	617 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TMEM54-205	ENST00000475208	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	CHL1	O00533	1208 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	BBOX1	O75936	387 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	WBP1L	Q9NX94	342 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	32.54	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	CXCL9	Q07325	125 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	GRAP	Q13588	217 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	MPND	Q8N594	471 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
TMEM54-205	ENST00000475208	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.52	■■■□□ 2.8

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