RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 PSMD1Q99460 953 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 COL4A5P29400 1685 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 ANXA1P04083 346 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 NEUROD2Q15784 382 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 IFFO2Q5TF58 517 aa23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 FZD9O00144 591 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 HOXB7P09629 217 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 KRT24Q2M2I5 525 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 SYNE4Q8N205 404 aa23.4■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 TAF1P21675 1872 aa23.39■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 COPS6Q7L5N1 327 aa23.39■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 POTEIP0CG38 1075 aa23.38■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 POTEJP0CG39 1038 aa23.38■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.38■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 CHADLQ6NUI6 762 aa23.38■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.38■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 CFAP44Q96MT7 982 aa23.37■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 TCIRG1Q13488 830 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 NLRP10Q86W26 655 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 NECTIN2Q92692 538 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 NLRP3Q96P20 1036 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 LTBP1Q14766 1721 aa23.36■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.35■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF853P0CG23 659 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 LDHDQ86WU2 507 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 GPC2Q8N158 579 aa23.34■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 SLC51AQ86UW1 340 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 HACL1Q9UJ83 578 aa23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SIKE1-205ENST00000466657 ABCC4O15439 1325 aa23.33■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 PASKQ96RG2 1323 aa23.33■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 JDP2Q8WYK2 163 aa23.32■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.32■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 MBIPQ9NS73 344 aa23.31■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 VPS33BQ9H267 617 aa23.3■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 CREBZFQ9NS37 354 aa23.3■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.3■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 APAF1O14727 1248 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 EPHX2P34913 555 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 BBOX1O75936 387 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 IFT57Q9NWB7 429 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 HYPKQ9NX55 129 aa23.28■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.27■■□□□ 1.32
SIKE1-205ENST00000466657 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 GNAI1P63096 354 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 SP8Q8IXZ3 490 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.26■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 SCNN1DP51172 638 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 COL4A1P02462 1669 aa23.24■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 PPIP5K2O43314 1243 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 GRAPQ13588 217 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 AOC3Q16853 763 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 NIM1KQ8IY84 436 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 TMC4Q7Z404 712 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-205ENST00000466657 CNTNAP1P78357 1384 aa23.21■■□□□ 1.31
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