RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439252.1

AC012066.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC012066.1, Length 694 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC012066.1-201ENST00000439252 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa16.14■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.14■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PASKQ96RG2 1323 aa16.14■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 NTSR2O95665 410 aa16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 GPC2Q8N158 579 aa16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 NLRP3Q96P20 1036 aa16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 ERBB4Q15303 1308 aa16.13■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PDIA6Q15084 440 aa16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PARP10Q53GL7 1025 aa16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 SLC51AQ86UW1 340 aa16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 NECTIN2Q92692 538 aa16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.12■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 RALBP1Q15311 655 aa16.11■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 NEUROD2Q15784 382 aa16.11■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PROSER3Q2NL68 480 aa16.11■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.11■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 CNTROBQ8N137 903 aa16.11■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 CNTNAP1P78357 1384 aa16.11■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 PCNTO95613 3336 aa16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 VEGFBP49765 207 aa16.09■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.09■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 COPS6Q7L5N1 327 aa16.09■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.09■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.09■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 SNED1Q8TER0 1413 aa16.09■□□□□ 0.17
AC012066.1-201ENST00000439252 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 NIM1KQ8IY84 436 aa16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 SCN4AP35499 1836 aa16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 NUP98P52948 1817 aa16.08■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 FOXN1O15353 648 aa16.07■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 PPIP5K2O43314 1243 aa16.07■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 EPS15P42566 896 aa16.07■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 KRT24Q2M2I5 525 aa16.07■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.07■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 SCNN1DP51172 638 aa16.06■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 AOC3Q16853 763 aa16.06■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.06■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.06■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 NLRP10Q86W26 655 aa16.06■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 ZNF428Q96B54 188 aa16.06■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 COL4A5P29400 1685 aa16.05■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 ABCC4O15439 1325 aa16.05■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 TCIRG1Q13488 830 aa16.05■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 AIDAQ96BJ3 306 aa16.05■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 CHL1O00533 1208 aa16.04■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 BBOX1O75936 387 aa16.04■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.04■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 RASSF10A6NK89 507 aa16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 SP8Q8IXZ3 490 aa16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 MPNDQ8N594 471 aa16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 RUNDC1Q96C34 613 aa16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 VPS33BQ9H267 617 aa16.03■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.02■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 CXCL9Q07325 125 aa16.02■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.02■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.02■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.02■□□□□ 0.16
AC012066.1-201ENST00000439252 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AC012066.1-201ENST00000439252 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa16.01■□□□□ 0.15
AC012066.1-201ENST00000439252 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AC012066.1-201ENST00000439252 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.01■□□□□ 0.15
AC012066.1-201ENST00000439252 WBP1LQ9NX94 342 aa16.01■□□□□ 0.15
AC012066.1-201ENST00000439252 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.01■□□□□ 0.15
AC012066.1-201ENST00000439252 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms