RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 SLC51AQ86UW1 340 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 LDHDQ86WU2 507 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 TNS4Q8IZW8 715 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 CREBZFQ9NS37 354 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-208ENST00000438888 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 SUSD4Q5VX71 490 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 HACL1Q9UJ83 578 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 ANXA1P04083 346 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 CRY2Q49AN0 593 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 EPHX2P34913 555 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 RIPK4P57078 832 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 JDP2Q8WYK2 163 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 NECTIN2Q92692 538 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 FZD9O00144 591 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 APAF1O14727 1248 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 NTSR2O95665 410 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 PROSER3Q2NL68 480 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 PSMD1Q99460 953 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 SNED1Q8TER0 1413 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 NUP98P52948 1817 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 PASKQ96RG2 1323 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 ERBB4Q15303 1308 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 COL4A5P29400 1685 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 SCN4AP35499 1836 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 NEUROD2Q15784 382 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 GPC2Q8N158 579 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 ZNF428Q96B54 188 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-208ENST00000438888 CNTNAP1P78357 1384 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 PDIA6Q15084 440 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 PARP10Q53GL7 1025 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 PPIP5K2O43314 1243 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 KRT24Q2M2I5 525 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 CNTROBQ8N137 903 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 NLRP3Q96P20 1036 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 VEGFBP49765 207 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 AOC3Q16853 763 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 COPS6Q7L5N1 327 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 NIM1KQ8IY84 436 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 ABCC4O15439 1325 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 FOXN1O15353 648 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 EPS15P42566 896 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 SCNN1DP51172 638 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 CCDC27Q2M243 656 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 AIDAQ96BJ3 306 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 LTBP1Q14766 1721 aa16.08■□□□□ 0.17
PRAME-208ENST00000438888 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.166e-14■□□□□ 9.2
PRAME-208ENST00000438888 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 NLRP10Q86W26 655 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 ZNF521Q96K83 1311 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 GRM1Q13255 1194 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PRAME-208ENST00000438888 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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