RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.45■■□□□ 1.67
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 FZD9O00144 591 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 PSMD1Q99460 953 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 SCN4AP35499 1836 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 GPC2Q8N158 579 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 SLC51AQ86UW1 340 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 CNTROBQ8N137 903 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 NTSR2O95665 410 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 ANXA1P04083 346 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 VEGFBP49765 207 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 RIPK4P57078 832 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 NECTIN2Q92692 538 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 AIDAQ96BJ3 306 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 NUP98P52948 1817 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 FOXN1O15353 648 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 NLRP3Q96P20 1036 aa25.39■■□□□ 1.66
UBXN4-202ENST00000415164 ERBB4Q15303 1308 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 PARP10Q53GL7 1025 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 NIM1KQ8IY84 436 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 PPIP5K2O43314 1243 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 SNED1Q8TER0 1413 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 PROSER3Q2NL68 480 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 COL4A5P29400 1685 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 EPS15P42566 896 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 NEUROD2Q15784 382 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 AOC3Q16853 763 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF428Q96B54 188 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.33■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 GRM1Q13255 1194 aa25.33■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 PDIA6Q15084 440 aa25.33■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.33■■□□□ 1.65
UBXN4-202ENST00000415164 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 SCNN1DP51172 638 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 COPS6Q7L5N1 327 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC4O15439 1325 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.642e-11■□□□□ 10.8
UBXN4-202ENST00000415164 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.3■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 RASSF10A6NK89 507 aa25.29■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 RALBP1Q15311 655 aa25.29■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.29■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 LBX1P52954 281 aa25.28■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.28■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 LTBP1Q14766 1721 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 KRT24Q2M2I5 525 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 NLRP10Q86W26 655 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-202ENST00000415164 TRAF5O00463 557 aa25.26■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 WBP1LQ9NX94 342 aa25.26■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 MPNDQ8N594 471 aa25.25■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.25■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.24■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 BBOX1O75936 387 aa25.24■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 TCIRG1Q13488 830 aa25.24■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.24■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.24■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 CXCL9Q07325 125 aa25.23■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
UBXN4-202ENST00000415164 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.23■■□□□ 1.63
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