RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.65■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 Q6ZUG5 572 aa20.65■□□□□ 0.9
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SIRT1-201ENST00000212015 USP44Q9H0E7 712 aa20.65■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 NEK1Q96PY6 1258 aa20.64■□□□□ 0.9
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM29Q14134 588 aa20.64■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 TAF3Q5VWG9 929 aa20.64■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.64■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.64■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 A0A1B0GVL5 298 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 VPS53Q5VIR6 699 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 IL25Q9H293 177 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 IFNKQ9P0W0 207 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 PTPN21Q16825 1174 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF853P0CG23 659 aa20.63■□□□□ 0.89
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SIRT1-201ENST00000212015 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 EYA1Q99502 592 aa20.63■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.62■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 LMAN1P49257 510 aa20.62■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 PSME1Q06323 249 aa20.62■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.61■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.61■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.61■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC102AQ96A19 550 aa20.61■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 GNG11P61952 73 aa20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 HYPKQ9NX55 129 aa20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 SNRKQ9NRH2 765 aa20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.6■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 APOBRQ0VD83 1088 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 PDE4CQ08493 712 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 KRT32Q14532 448 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 MCM6Q14566 821 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 RGS12O14924 1447 aa20.59■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 ABCC1P33527 1531 aa20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 FAM193AP78312 1265 aa20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 GOLIM4O00461 696 aa20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SIRT1-201ENST00000212015 C8orf76Q96K31 380 aa20.58■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.58■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 SLC27A2O14975 620 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 MYD88Q99836 296 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PHACTR2O75167 634 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PIK3R4Q99570 1358 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 NEMFO60524 1076 aa20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 AK7Q96M32 723 aa20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 NPATQ14207 1427 aa20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.56■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 ST7Q9NRC1 585 aa20.55■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 TRPM2O94759 1503 aa20.55■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 TPM1P09493 284 aa20.55■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 GSDMDP57764 484 aa20.55■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 ZFYVE9O95405 1425 aa20.55■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 MADDQ8WXG6 1647 aa20.55■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 USP27XA6NNY8 438 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CTAGE5O15320 804 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 NEK11Q8NG66 645 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PTCH1Q13635 1447 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 UBASH3AP57075 661 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 ATP7AQ04656 1500 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 CLTCL1P53675 1640 aa20.54■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SIRT1-201ENST00000212015 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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