RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SH3D21A4FU49 640 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SUV39H1O43463 412 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RGS14O43566 566 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MELKQ14680 651 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM14Q96QK8 99 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 HDAC8Q9BY41 377 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 AIPO00170 330 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC28A1O00337 649 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SSNA1O43805 119 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SH3BP5O60239 455 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ADRB1P08588 477 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 COL9A1P20849 921 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GIFP27352 417 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KCNJ3P48549 501 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TEX26Q8N6G2 289 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf66Q96MD2 445 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FZD3Q9NPG1 666 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LHX6Q9UPM6 363 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZAR1LA6NP61 321 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SULT1B1O43704 296 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GASTP01350 101 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TCRBP04435 133 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C1SP09871 688 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA8P13928 327 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RGS4P49798 205 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FGL1Q08830 312 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TCTE1Q5JU00 501 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 AFMIDQ63HM1 303 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.46□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 FATE1Q969F0 183 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PANX1Q96RD7 426 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CD93Q9NPY3 652 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GULP1Q9UBP9 304 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CACNA1HO95180 2353 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GPR39O43194 453 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 THEGLP0DJG4 465 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RAB3BP20337 219 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ITPKAP23677 461 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CD79BP40259 229 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TTPAP49638 278 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR1S1Q8NH92 325 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN23Q96B33 292 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM159Q96B96 161 aa9.46□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 NLNQ9BYT8 704 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 USP34Q70CQ2 3546 aa9.46□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PEX11BO96011 259 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PIPP12273 146 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ALDH9A1P49189 494 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP82Q8N141 532 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PDFQ9HBH1 243 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NINQ8N4C6 2090 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ULK1O75385 1050 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TNFP01375 233 aa9.46□□□□□ -0.9
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