RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390909.2

U3.20-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.20-201ENST00000390909 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ACADVLP49748 655 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ARHGDIBP52566 201 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 RIPK1Q13546 671 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 SLC10A1Q14973 349 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CHI3L2Q15782 390 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 USH1GQ495M9 461 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 EIPR1Q53HC9 387 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 LGSNQ5TDP6 509 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 NCR3LG1Q68D85 454 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ZNF600Q6ZNG1 722 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CENPUQ71F23 418 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 UNC5CLQ8IV45 518 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 NAXDQ8IW45 347 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 NANPQ8TBE9 248 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 TADA1Q96BN2 335 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CNDP1Q96KN2 507 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 TPPP3Q9BW30 176 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 GSDMCQ9BYG8 508 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 COMMD4Q9H0A8 199 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 TIGARQ9NQ88 270 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 GALPQ9UBC7 116 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CHRNA9Q9UGM1 479 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 SNX6Q9UNH7 406 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 HCFC1P51610 2035 aa2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 A0A087WWV3 80 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ESYT2A0FGR8 921 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 TRIM49BA6NDI0 452 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CTAGE5O15320 804 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 DUX1O43812 170 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 EFNA2O43921 213 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 KLHL41O60662 606 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 RHBDL1O75783 438 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ANP32DO95626 131 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CSF2P04141 144 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CT45A10P0DMU9 189 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 UMPSP11172 480 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 LAMP1P11279 417 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 DRD5P21918 477 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 SOX6P35712 828 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ALDH3B2P48448 385 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 EMDP50402 254 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ARFIP1P53367 373 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 IST1P53990 364 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ACTR1AP61163 376 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 IFT88Q13099 833 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 IL18R1Q13478 541 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 RUNX3Q13761 415 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 STAC2Q6ZMT1 411 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 LANCL3Q6ZV70 420 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CYS1Q717R9 158 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 OTUD6AQ7L8S5 288 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 OR2T34Q8NGX1 318 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 OSTF1Q92882 214 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 TM2D1Q9BX74 207 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 HCAR1Q9BXC0 346 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 RHOJQ9H4E5 214 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 POLD4Q9HCU8 107 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 PALMDQ9NP74 551 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 ELOVL2Q9NXB9 296 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 PCSK1NQ9UHG2 260 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 TMED5Q9Y3A6 229 aa2.75□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CTAGE15A4D2H0 777 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 FAM74A7A6NL05 159 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 EFCAB7A8K855 629 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 G3V3Y1 287 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 CLDN5O00501 218 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 SLC17A2O00624 439 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 GPRIN2O60269 458 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 STX11O75558 287 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 NEBLO76041 1014 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 UFL1O94874 794 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 MFN2O95140 757 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 GJB5O95377 273 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 PRAMEF12O95522 483 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 OPN1LWP04000 364 aa2.74□□□□□ -1.97
U3.20-201ENST00000390909 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms