RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438005.1

MTND5P28-201, Transcript of MT-ND5 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene MTND5P28, Length 1,594 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTND5P28-201ENST00000438005 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 NFE4Q86UQ8 179 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ALLCQ8N6M5 410 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 GSDMAQ96QA5 445 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 CHP1Q99653 195 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ANKRA2Q9H9E1 313 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 PTPRGP23470 1445 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 LRP5LA4QPB2 252 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ARHGEF9O43307 516 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ALOX5P09917 674 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 POU2F1P14859 743 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ETS2P15036 469 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 MMP11P24347 488 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 NMT1P30419 496 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 NF2P35240 595 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 MAGEA1P43355 309 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 HAND2P61296 217 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 C1orf61Q13536 156 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 MTF1Q14872 753 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SFT2D3Q587I9 215 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 LIPNQ5VXI9 398 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TMEM17Q86X19 198 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 CLDN19Q8N6F1 224 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 OR9Q2Q8NGE9 314 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 C7orf34Q96L11 122 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 C12orf66Q96MD2 445 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 MTMR9Q96QG7 549 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 Q9HAA7 133 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 THEGQ9P2T0 379 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 KLK11Q9UBX7 282 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.55□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 METP08581 1390 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 PNPLA6Q8IY17 1366 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 TEX14Q8IWB6 1497 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 A0A1B0GTQ1 180 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 PDLIM1O00151 329 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 KCNAB3O43448 404 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 AKR7A2O43488 359 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 STX11O75558 287 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 PAHP00439 452 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 F10P00742 488 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SP1P08047 785 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ERVK-10P10266 1014 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 RALBP11234 206 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 PGCP20142 388 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 EDNRAP25101 427 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 SAA4P35542 130 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 FDFT1P37268 417 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 P2RY1P47900 373 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 POU3F4P49335 361 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 ATP1B3P54709 279 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 PEX3P56589 373 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 DMTNQ08495 405 aa3.54□□□□□ -1.84
MTND5P28-201ENST00000438005 BNIP1Q12981 228 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms