RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
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CHTF18-202ENST00000317063 S100A6P06703 90 aa15.19■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 STX4Q12846 297 aa15.19■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 SQSTM1Q13501 440 aa15.19■□□□□ 0.02
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CHTF18-202ENST00000317063 COQ10BQ9H8M1 238 aa15.19■□□□□ 0.02
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CHTF18-202ENST00000317063 KMT5CQ86Y97 462 aa15.18■□□□□ 0.02
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CHTF18-202ENST00000317063 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 SLC47A1Q96FL8 570 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 EDEM2Q9BV94 578 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 NECTIN3Q9NQS3 549 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF292O60281 2723 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 SAC3D1A6NKF1 404 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 C4orf47A7E2U8 309 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 TOR1AO14656 332 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 OR10H2O60403 315 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 GPIP06744 558 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 FHP07954 510 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF806P0C7X5 589 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 TTKP33981 857 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 CHRNB3Q05901 458 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 ZMYND11Q15326 602 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 TOR2AQ5JU69 321 aa15.18■□□□□ 0.02
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM19Q96HH6 336 aa15.18■□□□□ 0.02
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