RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dctn6Q9WUB4 190 aa9.6□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vps13aQ5H8C4 3166 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp442A2AQA0 667 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf217D3YYI7 515 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm21800J3QMJ9 180 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hsd3b6O35469 373 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pmm1O35621 262 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gabrg2P22723 474 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptpn22P29352 802 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pax7P47239 503 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Evx2P49749 475 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Taf1aP97357 453 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map3k8Q07174 467 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmc6Q7TN60 810 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rsbn1Q80T69 795 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kansl1Q80TG1 1036 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zc3hc1Q80YV2 501 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptpn7Q8BUM3 359 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Guf1Q8C3X4 651 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhac1Q91Y10 964 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrgpra7Q91ZC5 305 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc46a3Q9DC26 460 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Isoc2bQ9DCC7 210 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nectin3Q9JLB9 549 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pmm2Q9Z2M7 242 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Heatr5bQ8C547 2070 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Esp31A8R0W3 114 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clip3B9EHT4 547 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r98E9PZ56 857 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Enthd1E9Q1Z2 618 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01654 111 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01656 111 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mtnd1P03888 318 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P03977 111 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klrb1aP27811 227 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mmp12P34960 473 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FahP35505 419 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PhexP70669 749 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SgcdP82347 289 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kdm4dQ3U2K5 510 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tvp23aQ6NVH0 222 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tas2r13Q7M720 305 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc126Q8BIS8 140 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfsd11Q8BJ51 449 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gen1Q8BMI4 908 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf167Q91XF4 347 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tsga8Q9JJL0 238 aa9.59□□□□□ -0.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 9930021J03RikH3BKP8 2027 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr634-ps1A0A1B0GRN7 318 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc9a5B2RXE2 898 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm17728E9Q5K2 132 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cldn34aG3UW52 211 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P03976 113 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klk1P15947 261 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NelfeP19426 375 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 S100a9P31725 113 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Thbs1P35441 1170 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AcadmP45952 421 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdk5P49615 292 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GlaP51569 419 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efna1P52793 205 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MazP56671 477 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nup43P59235 380 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ypel5P62700 121 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MocosQ14CH1 862 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bcl2a1bQ497M6 172 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ripk1Q60855 656 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam12Q61824 903 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abhd16bQ80YU0 474 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NapepldQ8BH82 396 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hcar1Q8C131 343 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxl8Q8CIG9 374 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plac9Q8K262 108 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NagsQ8R4H7 527 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mospd1Q8VEL0 213 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kiss1rQ91V45 396 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acsm1Q91VA0 573 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Paip2bQ91W45 136 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sh3bp4Q921I6 962 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam174aQ9D3L0 190 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phf6Q9D4J7 364 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hspb11Q9D6H2 143 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpini2Q9JK88 405 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dapp1Q9QXT1 280 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpk1Q9R0M5 243 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dennd4cA6H8H2 1906 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Col4a4Q9QZR9 1682 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Col9a3A2ACT7 680 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Esp22A8R0V4 111 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam84bD3YXJ5 310 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr287E9PZS7 322 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr521E9Q519 321 aa9.58□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms