Protein–RNA interactions for Protein: P27811

Klrb1a, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1aP27811 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Klrb1aP27811 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Klrb1aP27811 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Klrb1aP27811 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Klrb1aP27811 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Klrb1aP27811 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Klrb1aP27811 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Klrb1aP27811 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Klrb1aP27811 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Klrb1aP27811 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Klrb1aP27811 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Klrb1aP27811 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Klrb1aP27811 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Klrb1aP27811 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Klrb1aP27811 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klrb1aP27811 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klrb1aP27811 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klrb1aP27811 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Klrb1aP27811 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Klrb1aP27811 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Klrb1aP27811 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klrb1aP27811 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Klrb1aP27811 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klrb1aP27811 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Klrb1aP27811 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Klrb1aP27811 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Klrb1aP27811 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Klrb1aP27811 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klrb1aP27811 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klrb1aP27811 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Klrb1aP27811 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klrb1aP27811 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klrb1aP27811 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klrb1aP27811 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klrb1aP27811 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klrb1aP27811 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Klrb1aP27811 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klrb1aP27811 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Klrb1aP27811 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Klrb1aP27811 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Klrb1aP27811 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Klrb1aP27811 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Klrb1aP27811 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Klrb1aP27811 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klrb1aP27811 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klrb1aP27811 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Klrb1aP27811 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Klrb1aP27811 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klrb1aP27811 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Klrb1aP27811 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klrb1aP27811 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klrb1aP27811 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klrb1aP27811 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klrb1aP27811 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klrb1aP27811 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klrb1aP27811 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klrb1aP27811 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Klrb1aP27811 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klrb1aP27811 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klrb1aP27811 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Klrb1aP27811 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klrb1aP27811 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klrb1aP27811 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Klrb1aP27811 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klrb1aP27811 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klrb1aP27811 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Klrb1aP27811 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Klrb1aP27811 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Klrb1aP27811 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Klrb1aP27811 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klrb1aP27811 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klrb1aP27811 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Klrb1aP27811 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Klrb1aP27811 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Klrb1aP27811 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klrb1aP27811 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klrb1aP27811 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Klrb1aP27811 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klrb1aP27811 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klrb1aP27811 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klrb1aP27811 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klrb1aP27811 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klrb1aP27811 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klrb1aP27811 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klrb1aP27811 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klrb1aP27811 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klrb1aP27811 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klrb1aP27811 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klrb1aP27811 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klrb1aP27811 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klrb1aP27811 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klrb1aP27811 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klrb1aP27811 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms