Protein–RNA interactions for Protein: P31725

S100a9, Protein S100-A9, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100a9P31725 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
S100a9P31725 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
S100a9P31725 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
S100a9P31725 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
S100a9P31725 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
S100a9P31725 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
S100a9P31725 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
S100a9P31725 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
S100a9P31725 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
S100a9P31725 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
S100a9P31725 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
S100a9P31725 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
S100a9P31725 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
S100a9P31725 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
S100a9P31725 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
S100a9P31725 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
S100a9P31725 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
S100a9P31725 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
S100a9P31725 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
S100a9P31725 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
S100a9P31725 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
S100a9P31725 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
S100a9P31725 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
S100a9P31725 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
S100a9P31725 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
S100a9P31725 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
S100a9P31725 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
S100a9P31725 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
S100a9P31725 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
S100a9P31725 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
S100a9P31725 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
S100a9P31725 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
S100a9P31725 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
S100a9P31725 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
S100a9P31725 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
S100a9P31725 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,81
S100a9P31725 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,81
S100a9P31725 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
S100a9P31725 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
S100a9P31725 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
S100a9P31725 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
S100a9P31725 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,17■■□□□ 1,78
S100a9P31725 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
S100a9P31725 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
S100a9P31725 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
S100a9P31725 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
S100a9P31725 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,85■■□□□ 1,73
S100a9P31725 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
S100a9P31725 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
S100a9P31725 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
S100a9P31725 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
S100a9P31725 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
S100a9P31725 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
S100a9P31725 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
S100a9P31725 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
S100a9P31725 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
S100a9P31725 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
S100a9P31725 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
S100a9P31725 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
S100a9P31725 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
S100a9P31725 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
S100a9P31725 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
S100a9P31725 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
S100a9P31725 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
S100a9P31725 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
S100a9P31725 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
S100a9P31725 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
S100a9P31725 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
S100a9P31725 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
S100a9P31725 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
S100a9P31725 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
S100a9P31725 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
S100a9P31725 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
S100a9P31725 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
S100a9P31725 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
S100a9P31725 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
S100a9P31725 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
S100a9P31725 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
S100a9P31725 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
S100a9P31725 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
S100a9P31725 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
S100a9P31725 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
S100a9P31725 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
S100a9P31725 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
S100a9P31725 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
S100a9P31725 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,08■■□□□ 1,6
S100a9P31725 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
S100a9P31725 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
S100a9P31725 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
S100a9P31725 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
S100a9P31725 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,92■■□□□ 1,58
S100a9P31725 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
S100a9P31725 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
S100a9P31725 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
S100a9P31725 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
S100a9P31725 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
S100a9P31725 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
S100a9P31725 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
S100a9P31725 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
S100a9P31725 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms