Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SgcdP82347 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SgcdP82347 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SgcdP82347 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SgcdP82347 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SgcdP82347 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SgcdP82347 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SgcdP82347 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SgcdP82347 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SgcdP82347 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SgcdP82347 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SgcdP82347 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SgcdP82347 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SgcdP82347 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SgcdP82347 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SgcdP82347 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SgcdP82347 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SgcdP82347 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SgcdP82347 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SgcdP82347 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SgcdP82347 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SgcdP82347 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SgcdP82347 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SgcdP82347 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SgcdP82347 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SgcdP82347 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SgcdP82347 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SgcdP82347 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SgcdP82347 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SgcdP82347 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SgcdP82347 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SgcdP82347 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SgcdP82347 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SgcdP82347 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SgcdP82347 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SgcdP82347 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SgcdP82347 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SgcdP82347 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SgcdP82347 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SgcdP82347 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SgcdP82347 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SgcdP82347 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SgcdP82347 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SgcdP82347 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SgcdP82347 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SgcdP82347 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SgcdP82347 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SgcdP82347 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SgcdP82347 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SgcdP82347 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SgcdP82347 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SgcdP82347 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SgcdP82347 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SgcdP82347 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SgcdP82347 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SgcdP82347 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SgcdP82347 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SgcdP82347 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SgcdP82347 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SgcdP82347 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SgcdP82347 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SgcdP82347 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SgcdP82347 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SgcdP82347 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SgcdP82347 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SgcdP82347 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SgcdP82347 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SgcdP82347 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SgcdP82347 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SgcdP82347 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SgcdP82347 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SgcdP82347 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SgcdP82347 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SgcdP82347 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SgcdP82347 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SgcdP82347 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SgcdP82347 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SgcdP82347 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SgcdP82347 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SgcdP82347 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SgcdP82347 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SgcdP82347 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SgcdP82347 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SgcdP82347 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SgcdP82347 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SgcdP82347 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SgcdP82347 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SgcdP82347 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SgcdP82347 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SgcdP82347 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SgcdP82347 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SgcdP82347 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SgcdP82347 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SgcdP82347 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SgcdP82347 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SgcdP82347 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SgcdP82347 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SgcdP82347 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SgcdP82347 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SgcdP82347 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms