Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Nectin3Q9JLB9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nectin3Q9JLB9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nectin3Q9JLB9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nectin3Q9JLB9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nectin3Q9JLB9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nectin3Q9JLB9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nectin3Q9JLB9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Nectin3Q9JLB9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nectin3Q9JLB9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nectin3Q9JLB9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nectin3Q9JLB9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Nectin3Q9JLB9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nectin3Q9JLB9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nectin3Q9JLB9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nectin3Q9JLB9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nectin3Q9JLB9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nectin3Q9JLB9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nectin3Q9JLB9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nectin3Q9JLB9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nectin3Q9JLB9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nectin3Q9JLB9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nectin3Q9JLB9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nectin3Q9JLB9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nectin3Q9JLB9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nectin3Q9JLB9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nectin3Q9JLB9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nectin3Q9JLB9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nectin3Q9JLB9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nectin3Q9JLB9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nectin3Q9JLB9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nectin3Q9JLB9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nectin3Q9JLB9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nectin3Q9JLB9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nectin3Q9JLB9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nectin3Q9JLB9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nectin3Q9JLB9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nectin3Q9JLB9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nectin3Q9JLB9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nectin3Q9JLB9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nectin3Q9JLB9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nectin3Q9JLB9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nectin3Q9JLB9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nectin3Q9JLB9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nectin3Q9JLB9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nectin3Q9JLB9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nectin3Q9JLB9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nectin3Q9JLB9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nectin3Q9JLB9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nectin3Q9JLB9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nectin3Q9JLB9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nectin3Q9JLB9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nectin3Q9JLB9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nectin3Q9JLB9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nectin3Q9JLB9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nectin3Q9JLB9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nectin3Q9JLB9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nectin3Q9JLB9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nectin3Q9JLB9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nectin3Q9JLB9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nectin3Q9JLB9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nectin3Q9JLB9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nectin3Q9JLB9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nectin3Q9JLB9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nectin3Q9JLB9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nectin3Q9JLB9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nectin3Q9JLB9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nectin3Q9JLB9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nectin3Q9JLB9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nectin3Q9JLB9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nectin3Q9JLB9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nectin3Q9JLB9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nectin3Q9JLB9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nectin3Q9JLB9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nectin3Q9JLB9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nectin3Q9JLB9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nectin3Q9JLB9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nectin3Q9JLB9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nectin3Q9JLB9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nectin3Q9JLB9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nectin3Q9JLB9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nectin3Q9JLB9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nectin3Q9JLB9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nectin3Q9JLB9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nectin3Q9JLB9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nectin3Q9JLB9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nectin3Q9JLB9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nectin3Q9JLB9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nectin3Q9JLB9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nectin3Q9JLB9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nectin3Q9JLB9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nectin3Q9JLB9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nectin3Q9JLB9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nectin3Q9JLB9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nectin3Q9JLB9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nectin3Q9JLB9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nectin3Q9JLB9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms