Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NelfeP19426 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NelfeP19426 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NelfeP19426 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NelfeP19426 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NelfeP19426 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NelfeP19426 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
NelfeP19426 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NelfeP19426 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NelfeP19426 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NelfeP19426 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NelfeP19426 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NelfeP19426 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NelfeP19426 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NelfeP19426 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NelfeP19426 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NelfeP19426 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NelfeP19426 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NelfeP19426 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NelfeP19426 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NelfeP19426 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NelfeP19426 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NelfeP19426 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NelfeP19426 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NelfeP19426 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NelfeP19426 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NelfeP19426 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NelfeP19426 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NelfeP19426 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NelfeP19426 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NelfeP19426 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NelfeP19426 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NelfeP19426 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NelfeP19426 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NelfeP19426 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NelfeP19426 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NelfeP19426 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NelfeP19426 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NelfeP19426 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NelfeP19426 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NelfeP19426 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NelfeP19426 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NelfeP19426 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NelfeP19426 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NelfeP19426 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NelfeP19426 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NelfeP19426 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NelfeP19426 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NelfeP19426 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NelfeP19426 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NelfeP19426 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NelfeP19426 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NelfeP19426 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NelfeP19426 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NelfeP19426 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NelfeP19426 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NelfeP19426 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NelfeP19426 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NelfeP19426 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NelfeP19426 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NelfeP19426 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NelfeP19426 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NelfeP19426 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NelfeP19426 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NelfeP19426 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NelfeP19426 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NelfeP19426 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NelfeP19426 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NelfeP19426 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NelfeP19426 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NelfeP19426 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NelfeP19426 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NelfeP19426 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NelfeP19426 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NelfeP19426 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NelfeP19426 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NelfeP19426 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NelfeP19426 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NelfeP19426 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NelfeP19426 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NelfeP19426 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NelfeP19426 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NelfeP19426 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NelfeP19426 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NelfeP19426 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NelfeP19426 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NelfeP19426 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NelfeP19426 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NelfeP19426 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NelfeP19426 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NelfeP19426 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NelfeP19426 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NelfeP19426 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NelfeP19426 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NelfeP19426 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NelfeP19426 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NelfeP19426 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NelfeP19426 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NelfeP19426 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NelfeP19426 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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