Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG9

Fbxl8, F-box/LRR-repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl8Q8CIG9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Fbxl8Q8CIG9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fbxl8Q8CIG9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fbxl8Q8CIG9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fbxl8Q8CIG9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Fbxl8Q8CIG9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Fbxl8Q8CIG9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fbxl8Q8CIG9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Fbxl8Q8CIG9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Fbxl8Q8CIG9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fbxl8Q8CIG9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fbxl8Q8CIG9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fbxl8Q8CIG9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Fbxl8Q8CIG9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fbxl8Q8CIG9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fbxl8Q8CIG9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Fbxl8Q8CIG9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fbxl8Q8CIG9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fbxl8Q8CIG9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fbxl8Q8CIG9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Fbxl8Q8CIG9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fbxl8Q8CIG9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fbxl8Q8CIG9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fbxl8Q8CIG9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fbxl8Q8CIG9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fbxl8Q8CIG9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Fbxl8Q8CIG9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fbxl8Q8CIG9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxl8Q8CIG9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxl8Q8CIG9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxl8Q8CIG9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fbxl8Q8CIG9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fbxl8Q8CIG9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fbxl8Q8CIG9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fbxl8Q8CIG9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxl8Q8CIG9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxl8Q8CIG9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbxl8Q8CIG9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbxl8Q8CIG9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxl8Q8CIG9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fbxl8Q8CIG9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fbxl8Q8CIG9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxl8Q8CIG9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fbxl8Q8CIG9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbxl8Q8CIG9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fbxl8Q8CIG9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fbxl8Q8CIG9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fbxl8Q8CIG9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fbxl8Q8CIG9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fbxl8Q8CIG9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbxl8Q8CIG9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbxl8Q8CIG9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbxl8Q8CIG9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxl8Q8CIG9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxl8Q8CIG9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxl8Q8CIG9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxl8Q8CIG9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxl8Q8CIG9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbxl8Q8CIG9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbxl8Q8CIG9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fbxl8Q8CIG9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fbxl8Q8CIG9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fbxl8Q8CIG9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fbxl8Q8CIG9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fbxl8Q8CIG9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fbxl8Q8CIG9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fbxl8Q8CIG9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fbxl8Q8CIG9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fbxl8Q8CIG9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fbxl8Q8CIG9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fbxl8Q8CIG9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fbxl8Q8CIG9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fbxl8Q8CIG9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fbxl8Q8CIG9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fbxl8Q8CIG9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxl8Q8CIG9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fbxl8Q8CIG9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fbxl8Q8CIG9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fbxl8Q8CIG9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fbxl8Q8CIG9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fbxl8Q8CIG9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fbxl8Q8CIG9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fbxl8Q8CIG9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fbxl8Q8CIG9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fbxl8Q8CIG9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Fbxl8Q8CIG9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fbxl8Q8CIG9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fbxl8Q8CIG9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxl8Q8CIG9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fbxl8Q8CIG9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fbxl8Q8CIG9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fbxl8Q8CIG9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fbxl8Q8CIG9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms