RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 RNF165Q6ZSG1 346 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 S100A7AQ86SG5 101 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GPR149Q86SP6 731 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAR1Q8WVX9 515 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM74Q96NL1 305 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ATG101Q9BSB4 218 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ABCB9Q9NP78 766 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM140Q9NV12 185 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C5AR2Q9P296 337 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa4.68□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PPM1 405 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM72CH0Y354 149 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KLF11O14901 512 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM13O60858 407 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 VAPBO95292 243 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ADAP00813 363 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV2-5P01817 119 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 THBS1P07996 1170 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SELPP16109 830 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TSHRP16473 764 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NPR2P20594 1047 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CD200P41217 278 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 EMP2P54851 167 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PPP2CBP62714 309 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PPP2CAP67775 309 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MC1RQ01726 317 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FGFBP1Q14512 234 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC157Q569K6 752 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RAB41Q5JT25 222 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GPRC6AQ5T6X5 926 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PLET1Q6UQ28 207 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NAA40Q86UY6 237 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM72BQ86X60 149 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DDIASQ8IXT1 998 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GHDCQ8N2G8 530 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM181AQ8N9Y4 354 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ASB15Q8WXK1 588 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HSD17B8Q92506 261 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RAB3CQ96E17 227 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MFRPQ9BY79 579 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF385DQ9H6B1 395 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OPTCQ9UBM4 332 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC35F4A4IF30 521 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DFFAO00273 331 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TP53I11O14683 189 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ASGR2P07307 311 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FOSL2P15408 326 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NQO2P16083 231 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TPSB2P20231 275 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BGNP21810 368 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PSMB4P28070 264 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM33P57088 247 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KLF10Q13118 480 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SEMA5AQ13591 1074 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TPSAB1Q15661 275 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.67□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PYY3Q5JQD4 70 aa4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.3 ms