RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cxcr4P70658 359 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Txnl4aP83877 142 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rps3aP97351 264 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Six1Q62231 284 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr309Q7TS01 308 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Spag1Q80ZX8 901 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr109Q8VG96 314 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Wdr61Q9ERF3 305 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Upk1bQ9Z2C6 260 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 MycsQ9Z304 431 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm3952A0A0A6YXJ1 191 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm7929A0A286YDV3 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mageb4A2A9R3 556 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1160A2AVT0 319 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm21103E9Q2Q1 267 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm21977F6U3N7 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8247F6VRJ8 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8220F6YKI2 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8005F6YKY3 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm3015F6ZAP6 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8212F6ZMY5 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm7954F7BAX1 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8138F7BY56 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8232F7CFJ3 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm17079F7D8Y4 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm3542K7N6U2 270 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8094K7N6U8 211 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8165L7N218 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8122L7N2C7 213 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm17078M0QW51 211 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mpzl2O70255 215 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ntf3P20181 258 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Grik2P39087 908 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 IduaP48441 634 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd80Q00609 306 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ei24Q61070 340 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1106Q7TR57 312 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc6a17Q8BJI1 727 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tceal5Q8CCT4 200 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 FgbQ8K0E8 481 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hspa12aQ8K0U4 675 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmem185bQ8R3R5 350 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1Q8VGI1 314 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr340Q8VGL0 312 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bcl2l14Q9CPT0 328 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Txndc17Q9CQM5 123 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Serpinb11Q9CQV3 388 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gje1Q9CX92 205 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dapl1Q9D757 107 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ap1s2Q9DB50 160 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cacng3Q9JJV5 315 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cfap44E9Q5M6 1843 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pgbd5D3YZI9 523 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cx3cl1O35188 395 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 St8sia2O35696 375 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Psmb10O35955 273 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 CyctP00015 105 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 JunbP09450 344 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 SrgnP13609 152 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 NelfeP19426 375 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rab8aP55258 207 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Adamts8P57110 905 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hif3aQ0VBL6 662 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Nxpe2Q3U095 558 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm5460Q3UQ97 254 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pramef8Q8CE24 480 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Irak3Q8K4B2 609 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zdhhc1Q8R0N9 484 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Smim14Q91VT8 99 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rnf167Q91XF4 347 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Taar1Q923Y8 332 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cep41Q99NF3 373 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sapcd1Q9CY86 146 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Isca2Q9DCB8 154 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 AgkQ9ESW4 421 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vamp5Q9Z2P8 102 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tnks1bp1P58871 1720 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 FAM186AQ9D9R9 1790 aa7.13□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm14862B1AV28 81 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm20431E9PY39 371 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Itga10E9Q6R1 1167 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr605E9Q838 314 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8020F6WLE9 229 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Phb2O35129 299 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sbk3P0C5K0 361 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd14P10810 366 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ephx2P34914 554 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lrig1P70193 1091 aa7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 JupQ02257 745 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Usp40-201ENSMUST00000040783 Eci3Q78JN3 317 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms