Protein–RNA interactions for Protein: P00015

Cyct, Cytochrome c, testis-specific, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyctP00015 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CyctP00015 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CyctP00015 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CyctP00015 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CyctP00015 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CyctP00015 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CyctP00015 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CyctP00015 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CyctP00015 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CyctP00015 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CyctP00015 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CyctP00015 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CyctP00015 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CyctP00015 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CyctP00015 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CyctP00015 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CyctP00015 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CyctP00015 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CyctP00015 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CyctP00015 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CyctP00015 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CyctP00015 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CyctP00015 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CyctP00015 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CyctP00015 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CyctP00015 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CyctP00015 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CyctP00015 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CyctP00015 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CyctP00015 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CyctP00015 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CyctP00015 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CyctP00015 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CyctP00015 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CyctP00015 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CyctP00015 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CyctP00015 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CyctP00015 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CyctP00015 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CyctP00015 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CyctP00015 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CyctP00015 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CyctP00015 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CyctP00015 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CyctP00015 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CyctP00015 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CyctP00015 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CyctP00015 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CyctP00015 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CyctP00015 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CyctP00015 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CyctP00015 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CyctP00015 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CyctP00015 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CyctP00015 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CyctP00015 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CyctP00015 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CyctP00015 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CyctP00015 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CyctP00015 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CyctP00015 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CyctP00015 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CyctP00015 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CyctP00015 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CyctP00015 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CyctP00015 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CyctP00015 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CyctP00015 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CyctP00015 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CyctP00015 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CyctP00015 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CyctP00015 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CyctP00015 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CyctP00015 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CyctP00015 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CyctP00015 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CyctP00015 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CyctP00015 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CyctP00015 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CyctP00015 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CyctP00015 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CyctP00015 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CyctP00015 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CyctP00015 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CyctP00015 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CyctP00015 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CyctP00015 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CyctP00015 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CyctP00015 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CyctP00015 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CyctP00015 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CyctP00015 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CyctP00015 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CyctP00015 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CyctP00015 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CyctP00015 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CyctP00015 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CyctP00015 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CyctP00015 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CyctP00015 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms