Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB8

Isca2, Iron-sulfur cluster assembly 2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca2Q9DCB8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Isca2Q9DCB8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Isca2Q9DCB8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Isca2Q9DCB8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Isca2Q9DCB8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Isca2Q9DCB8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Isca2Q9DCB8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Isca2Q9DCB8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Isca2Q9DCB8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Isca2Q9DCB8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Isca2Q9DCB8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Isca2Q9DCB8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Isca2Q9DCB8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Isca2Q9DCB8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Isca2Q9DCB8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Isca2Q9DCB8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Isca2Q9DCB8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Isca2Q9DCB8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Isca2Q9DCB8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Isca2Q9DCB8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Isca2Q9DCB8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Isca2Q9DCB8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Isca2Q9DCB8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Isca2Q9DCB8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Isca2Q9DCB8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Isca2Q9DCB8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Isca2Q9DCB8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Isca2Q9DCB8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Isca2Q9DCB8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Isca2Q9DCB8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Isca2Q9DCB8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Isca2Q9DCB8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Isca2Q9DCB8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Isca2Q9DCB8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Isca2Q9DCB8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Isca2Q9DCB8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Isca2Q9DCB8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Isca2Q9DCB8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Isca2Q9DCB8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Isca2Q9DCB8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Isca2Q9DCB8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Isca2Q9DCB8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Isca2Q9DCB8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Isca2Q9DCB8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Isca2Q9DCB8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Isca2Q9DCB8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Isca2Q9DCB8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Isca2Q9DCB8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Isca2Q9DCB8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Isca2Q9DCB8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Isca2Q9DCB8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Isca2Q9DCB8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Isca2Q9DCB8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Isca2Q9DCB8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Isca2Q9DCB8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Isca2Q9DCB8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Isca2Q9DCB8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Isca2Q9DCB8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Isca2Q9DCB8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Isca2Q9DCB8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Isca2Q9DCB8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Isca2Q9DCB8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Isca2Q9DCB8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Isca2Q9DCB8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Isca2Q9DCB8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Isca2Q9DCB8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Isca2Q9DCB8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca2Q9DCB8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Isca2Q9DCB8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Isca2Q9DCB8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Isca2Q9DCB8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Isca2Q9DCB8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Isca2Q9DCB8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Isca2Q9DCB8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Isca2Q9DCB8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Isca2Q9DCB8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Isca2Q9DCB8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Isca2Q9DCB8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Isca2Q9DCB8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Isca2Q9DCB8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Isca2Q9DCB8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Isca2Q9DCB8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Isca2Q9DCB8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Isca2Q9DCB8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Isca2Q9DCB8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Isca2Q9DCB8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Isca2Q9DCB8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Isca2Q9DCB8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Isca2Q9DCB8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Isca2Q9DCB8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Isca2Q9DCB8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Isca2Q9DCB8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Isca2Q9DCB8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Isca2Q9DCB8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Isca2Q9DCB8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Isca2Q9DCB8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Isca2Q9DCB8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Isca2Q9DCB8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Isca2Q9DCB8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Isca2Q9DCB8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms