Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Wdr61Q9ERF3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Wdr61Q9ERF3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Wdr61Q9ERF3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Wdr61Q9ERF3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Wdr61Q9ERF3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Wdr61Q9ERF3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Wdr61Q9ERF3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Wdr61Q9ERF3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Wdr61Q9ERF3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Wdr61Q9ERF3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Wdr61Q9ERF3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Wdr61Q9ERF3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Wdr61Q9ERF3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Wdr61Q9ERF3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Wdr61Q9ERF3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Wdr61Q9ERF3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Wdr61Q9ERF3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Wdr61Q9ERF3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Wdr61Q9ERF3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Wdr61Q9ERF3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Wdr61Q9ERF3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Wdr61Q9ERF3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Wdr61Q9ERF3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Wdr61Q9ERF3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Wdr61Q9ERF3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,95■■□□□ 1,75
Wdr61Q9ERF3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Wdr61Q9ERF3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Wdr61Q9ERF3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Wdr61Q9ERF3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Wdr61Q9ERF3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Wdr61Q9ERF3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Wdr61Q9ERF3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Wdr61Q9ERF3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Wdr61Q9ERF3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Wdr61Q9ERF3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Wdr61Q9ERF3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Wdr61Q9ERF3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Wdr61Q9ERF3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Wdr61Q9ERF3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Wdr61Q9ERF3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Wdr61Q9ERF3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Wdr61Q9ERF3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Wdr61Q9ERF3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Wdr61Q9ERF3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Wdr61Q9ERF3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Wdr61Q9ERF3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Wdr61Q9ERF3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr61Q9ERF3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Wdr61Q9ERF3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Wdr61Q9ERF3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Wdr61Q9ERF3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Wdr61Q9ERF3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Wdr61Q9ERF3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Wdr61Q9ERF3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Wdr61Q9ERF3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Wdr61Q9ERF3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Wdr61Q9ERF3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Wdr61Q9ERF3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Wdr61Q9ERF3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Wdr61Q9ERF3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Wdr61Q9ERF3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Wdr61Q9ERF3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Wdr61Q9ERF3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Wdr61Q9ERF3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Wdr61Q9ERF3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Wdr61Q9ERF3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Wdr61Q9ERF3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Wdr61Q9ERF3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Wdr61Q9ERF3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Wdr61Q9ERF3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Wdr61Q9ERF3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Wdr61Q9ERF3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Wdr61Q9ERF3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Wdr61Q9ERF3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Wdr61Q9ERF3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Wdr61Q9ERF3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Wdr61Q9ERF3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Wdr61Q9ERF3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Wdr61Q9ERF3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Wdr61Q9ERF3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Wdr61Q9ERF3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Wdr61Q9ERF3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Wdr61Q9ERF3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Wdr61Q9ERF3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Wdr61Q9ERF3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Wdr61Q9ERF3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Wdr61Q9ERF3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Wdr61Q9ERF3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Wdr61Q9ERF3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Wdr61Q9ERF3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Wdr61Q9ERF3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Wdr61Q9ERF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Wdr61Q9ERF3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Wdr61Q9ERF3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Wdr61Q9ERF3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Wdr61Q9ERF3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
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