RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 AKTIPQ9H8T0 292 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PNPOQ9NVS9 261 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 THAP1Q9NVV9 213 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 B4GALT7Q9UBV7 327 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 OR10H1Q9Y4A9 318 aa18.25■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 OR6C70A6NIJ9 312 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 REM1O75628 298 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 IGHG3P01860 377 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 RFPL3SP0C7P2 107 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PRPS1L1P21108 318 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 KRT20P35900 424 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PSG6Q00889 435 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ATG16L1Q676U5 607 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 DESI1Q6ICB0 168 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM81Q6P7N7 255 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PACS2Q86VP3 889 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 FAM57AQ8TBR7 257 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 SLC35A4Q96G79 324 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 COL21A1Q96P44 957 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 NODALQ96S42 347 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 NUF2Q9BZD4 464 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ASIC5Q9NY37 505 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PCNX1Q96RV3 2341 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 A1L4Q6 167 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TSPAN2O60636 221 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ABCB7O75027 752 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TPOP07202 933 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CELA3AP09093 270 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 G6PDP11413 515 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 MASP1P48740 699 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CPTPQ5TA50 214 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TRILQ7L0X0 811 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 HDXQ7Z353 690 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 DOLPP1Q86YN1 238 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 OR4N2Q8NGD1 307 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TMCO6Q96DC7 493 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC120Q96HB5 630 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ADOQ96SZ5 270 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 LDAHQ9H6V9 325 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ATAD3AQ9NVI7 634 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 QPCTLQ9NXS2 382 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 LIPGQ9Y5X9 500 aa18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1B0GVC2 190 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 LAMP1P11279 417 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 GP1BBP13224 206 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 IL12BP29460 328 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 SNTA1Q13424 505 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 EFR3AQ14156 821 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 MLC1Q15049 377 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 SLC30A6Q6NXT4 461 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CD163Q86VB7 1156 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 NATD1Q8N6N6 113 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 NTNG2Q96CW9 530 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM41AQ96HV5 264 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 MANSC1Q9H8J5 431 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 MEAF6Q9HAF1 191 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 C3orf14Q9HBI5 128 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 KLRF1Q9NZS2 232 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 MEMO1Q9Y316 297 aa18.22■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 NCKAP5O14513 1909 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PRB8 838 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 OR14I1A6ND48 311 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PRAMEF25A6NGN4 478 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 AQP7O14520 342 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 SUSD5O60279 629 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 HCN1O60741 890 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 GDF1P27539 372 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 MAN2A2P49641 1150 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PNLIPRP2P54317 469 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 PRKAG1P54619 331 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CLDN8P56748 225 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 C21orf58P58505 322 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 CYP27C1Q4G0S4 372 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 FNDC7Q5VTL7 733 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 SZRD1Q7Z422 152 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC34Q8IZ02 419 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 EID3Q8N140 333 aa18.21■□□□□ 0.51
CTPS1-206ENST00000470271 NUP43Q8NFH3 380 aa18.21■□□□□ 0.51
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