RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMED4Q7Z7H5 227 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NRMQ8IXM6 262 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VAPAQ9P0L0 249 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A6NIZ1 184 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GGT2P36268 569 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WNT4P56705 351 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAP1BP61224 184 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAP1AP62834 184 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EFR3AQ14156 821 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TFAP2CQ92754 450 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPR4P46093 362 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NTHL1P78549 312 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRNP1Q6NT89 227 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BORAQ6PGQ7 559 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CBLL1Q75N03 491 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ISL2Q96A47 359 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRP5O75197 1615 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C1orf105O95561 183 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IL33O95760 270 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDHA2P29803 388 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SOX2P48431 317 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTBP2P56545 445 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GATSQ8NAP1 163 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CD207Q9UJ71 328 aa15.4■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IL1RNP18510 177 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DNASE1L3Q13609 305 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DEFB119Q8N690 84 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ITPKCQ96DU7 683 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PEX11GQ96HA9 241 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.39■□□□□ 0.06
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CDKN2CP42773 168 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACTBP60709 375 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACTG1P63261 375 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NKX3-2P78367 333 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPATC1Q76KD6 591 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF534Q76KX8 674 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM46BQ96A09 425 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR4K3Q96R72 315 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPR83Q9NYM4 423 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ANKRD28O15084 1053 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR2T1O43869 369 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GTF2F2P13984 249 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAB3BP20337 219 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FUT4P22083 530 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ART1P52961 327 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FGL1Q08830 312 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NSDHLQ15738 373 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GTDC1Q4AE62 458 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMPRSS12Q86WS5 348 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GJD2Q9UKL4 321 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 H0YIV9 168 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CRABP1P29762 137 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAB40BQ12829 278 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FZD3Q9NPG1 666 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IL37Q9NZH6 218 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLD2O14939 933 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CA3P07451 260 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APOFQ13790 326 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ALG10Q5BKT4 473 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NINJ1Q92982 152 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PGAM5Q96HS1 289 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CACNA1SQ13698 1873 aa15.39■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NRAPQ86VF7 1730 aa15.38■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 E2F3O00716 465 aa15.38■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GJA8P48165 433 aa15.38■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SEMA3BQ13214 749 aa15.38■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.38■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.38■□□□□ 0.05
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms