RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf111Q99ML9 989 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtpbp8Q9CY28 285 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NarfQ9CYQ7 462 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eral1Q9CZU4 437 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Maf1Q9D0U6 258 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ift46Q9DB07 301 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mlf1Q9QWV4 267 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ros1Q78DX7 2340 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgef17Q80U35 2057 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dock9Q8BIK4 2055 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AtrQ9JKK8 2635 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13420A0A140LJJ2 248 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sec14l5B2RXM5 696 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EXOC1LB9EK06 172 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsf3D0VYS2 492 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Omt2aF6ZJR3 104 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srp72F8VQC1 671 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrkcshO08795 521 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-Q1O19441 368 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 KeraO35367 351 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itga5P11688 1053 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstm2P15626 218 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcgf2P23798 342 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pax7P47239 503 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vsnl1P62761 191 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3KNL4 93 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crtc2Q3U182 692 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3U7U4 132 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zscan26Q5RJ54 466 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifit3Q64345 403 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Opn5Q6VZZ7 377 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abhd17bQ7M759 288 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr92Q8BGF3 357 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NarsQ8BP47 559 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl7a1Q8C6B0 244 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp446Q8C9M8 523 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bdh2Q8JZV9 245 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrhdeQ8K093 1025 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cbr3Q8K354 277 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnot6Q8K3P5 557 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam32Q8K410 754 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BlmhQ8R016 455 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cplx3Q8R1B5 158 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr77Q8VEY9 312 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1393Q8VFA7 311 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr672Q8VG28 312 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MINDY3Q9CV28 444 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OoepQ9CWE6 164 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kti12Q9D1R2 351 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LhppQ9D7I5 270 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dydc1Q9D9T0 175 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olig2Q9EQW6 323 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tacc3Q9JJ11 631 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slco1a1Q9QXZ6 670 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vps29Q9QZ88 182 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ClnkQ9QZE2 435 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Svep1A2AVA0 3567 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Exph5Q0VAV2 1960 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm595A2AF73 655 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a54B1AUS6 473 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata6lB2RV46 347 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tarm1B6A8R8 288 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp282E9PVC2 666 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spdye4cI6XKQ3 339 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pmm1O35621 262 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3galt2O54905 422 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh5O55240 318 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scd1P13516 355 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pmp22P16646 161 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfrsf1bP25119 474 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myl2P51667 166 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx2Q00262 289 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tctn2Q2MV57 700 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb20Q30KP3 96 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pde12Q3TIU4 608 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mup20Q5FW60 181 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap44Q5SSM3 814 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CmahQ61419 577 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BocQ6AZB0 1110 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il20raQ6PHB0 546 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dclre1cQ8K4J0 705 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif3lQ8QZY1 564 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab38Q8QZZ8 211 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr510Q8VEW6 314 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sectm1aQ921W8 192 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt14Q9D142 222 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asb5Q9D1A4 329 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actrt2Q9D9L5 377 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lancl2Q9JJK2 450 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tuba8Q9JJZ2 449 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.4 ms