Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
H2-Q1O19441 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
H2-Q1O19441 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
H2-Q1O19441 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
H2-Q1O19441 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
H2-Q1O19441 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
H2-Q1O19441 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
H2-Q1O19441 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
H2-Q1O19441 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
H2-Q1O19441 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
H2-Q1O19441 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
H2-Q1O19441 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H2-Q1O19441 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
H2-Q1O19441 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
H2-Q1O19441 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
H2-Q1O19441 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
H2-Q1O19441 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H2-Q1O19441 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H2-Q1O19441 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
H2-Q1O19441 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H2-Q1O19441 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
H2-Q1O19441 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H2-Q1O19441 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
H2-Q1O19441 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
H2-Q1O19441 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
H2-Q1O19441 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
H2-Q1O19441 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
H2-Q1O19441 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H2-Q1O19441 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
H2-Q1O19441 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H2-Q1O19441 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
H2-Q1O19441 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
H2-Q1O19441 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
H2-Q1O19441 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H2-Q1O19441 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H2-Q1O19441 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H2-Q1O19441 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H2-Q1O19441 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H2-Q1O19441 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H2-Q1O19441 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H2-Q1O19441 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H2-Q1O19441 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H2-Q1O19441 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
H2-Q1O19441 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H2-Q1O19441 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
H2-Q1O19441 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H2-Q1O19441 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H2-Q1O19441 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H2-Q1O19441 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H2-Q1O19441 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H2-Q1O19441 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H2-Q1O19441 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2-Q1O19441 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2-Q1O19441 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
H2-Q1O19441 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2-Q1O19441 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
H2-Q1O19441 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2-Q1O19441 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2-Q1O19441 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H2-Q1O19441 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H2-Q1O19441 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2-Q1O19441 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2-Q1O19441 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H2-Q1O19441 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-Q1O19441 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-Q1O19441 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
H2-Q1O19441 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H2-Q1O19441 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Q1O19441 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H2-Q1O19441 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
H2-Q1O19441 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H2-Q1O19441 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H2-Q1O19441 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2-Q1O19441 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2-Q1O19441 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2-Q1O19441 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
H2-Q1O19441 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2-Q1O19441 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2-Q1O19441 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H2-Q1O19441 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2-Q1O19441 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2-Q1O19441 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2-Q1O19441 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2-Q1O19441 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2-Q1O19441 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2-Q1O19441 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2-Q1O19441 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2-Q1O19441 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2-Q1O19441 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2-Q1O19441 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2-Q1O19441 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2-Q1O19441 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2-Q1O19441 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2-Q1O19441 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2-Q1O19441 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2-Q1O19441 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2-Q1O19441 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2-Q1O19441 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2-Q1O19441 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2-Q1O19441 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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