Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK2

Lancl2, LanC-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl2Q9JJK2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Lancl2Q9JJK2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lancl2Q9JJK2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lancl2Q9JJK2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lancl2Q9JJK2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Lancl2Q9JJK2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lancl2Q9JJK2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lancl2Q9JJK2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Lancl2Q9JJK2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Lancl2Q9JJK2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lancl2Q9JJK2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lancl2Q9JJK2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lancl2Q9JJK2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Lancl2Q9JJK2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lancl2Q9JJK2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lancl2Q9JJK2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lancl2Q9JJK2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lancl2Q9JJK2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lancl2Q9JJK2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lancl2Q9JJK2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lancl2Q9JJK2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lancl2Q9JJK2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lancl2Q9JJK2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lancl2Q9JJK2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lancl2Q9JJK2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lancl2Q9JJK2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lancl2Q9JJK2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lancl2Q9JJK2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lancl2Q9JJK2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lancl2Q9JJK2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lancl2Q9JJK2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lancl2Q9JJK2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lancl2Q9JJK2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lancl2Q9JJK2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lancl2Q9JJK2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lancl2Q9JJK2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lancl2Q9JJK2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lancl2Q9JJK2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lancl2Q9JJK2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lancl2Q9JJK2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lancl2Q9JJK2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lancl2Q9JJK2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lancl2Q9JJK2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lancl2Q9JJK2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lancl2Q9JJK2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lancl2Q9JJK2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lancl2Q9JJK2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lancl2Q9JJK2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lancl2Q9JJK2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lancl2Q9JJK2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lancl2Q9JJK2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lancl2Q9JJK2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lancl2Q9JJK2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lancl2Q9JJK2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lancl2Q9JJK2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lancl2Q9JJK2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lancl2Q9JJK2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lancl2Q9JJK2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lancl2Q9JJK2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lancl2Q9JJK2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lancl2Q9JJK2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lancl2Q9JJK2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lancl2Q9JJK2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lancl2Q9JJK2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lancl2Q9JJK2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lancl2Q9JJK2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lancl2Q9JJK2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lancl2Q9JJK2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lancl2Q9JJK2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lancl2Q9JJK2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lancl2Q9JJK2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lancl2Q9JJK2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lancl2Q9JJK2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lancl2Q9JJK2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lancl2Q9JJK2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lancl2Q9JJK2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lancl2Q9JJK2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lancl2Q9JJK2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lancl2Q9JJK2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lancl2Q9JJK2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lancl2Q9JJK2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lancl2Q9JJK2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lancl2Q9JJK2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lancl2Q9JJK2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lancl2Q9JJK2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lancl2Q9JJK2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lancl2Q9JJK2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lancl2Q9JJK2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Lancl2Q9JJK2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lancl2Q9JJK2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lancl2Q9JJK2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lancl2Q9JJK2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lancl2Q9JJK2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lancl2Q9JJK2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lancl2Q9JJK2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lancl2Q9JJK2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lancl2Q9JJK2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lancl2Q9JJK2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lancl2Q9JJK2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lancl2Q9JJK2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms