Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ8

Rab38, Ras-related protein Rab-38, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab38Q8QZZ8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Rab38Q8QZZ8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Rab38Q8QZZ8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Rab38Q8QZZ8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Rab38Q8QZZ8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Rab38Q8QZZ8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Rab38Q8QZZ8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Rab38Q8QZZ8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Rab38Q8QZZ8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rab38Q8QZZ8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Rab38Q8QZZ8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Rab38Q8QZZ8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Rab38Q8QZZ8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Rab38Q8QZZ8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rab38Q8QZZ8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Rab38Q8QZZ8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Rab38Q8QZZ8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Rab38Q8QZZ8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Rab38Q8QZZ8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Rab38Q8QZZ8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Rab38Q8QZZ8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rab38Q8QZZ8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rab38Q8QZZ8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rab38Q8QZZ8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Rab38Q8QZZ8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Rab38Q8QZZ8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Rab38Q8QZZ8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rab38Q8QZZ8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rab38Q8QZZ8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rab38Q8QZZ8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rab38Q8QZZ8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rab38Q8QZZ8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rab38Q8QZZ8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Rab38Q8QZZ8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Rab38Q8QZZ8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rab38Q8QZZ8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rab38Q8QZZ8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rab38Q8QZZ8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Rab38Q8QZZ8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Rab38Q8QZZ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rab38Q8QZZ8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rab38Q8QZZ8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,53■■■□□ 2
Rab38Q8QZZ8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rab38Q8QZZ8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Rab38Q8QZZ8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rab38Q8QZZ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rab38Q8QZZ8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Rab38Q8QZZ8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Rab38Q8QZZ8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rab38Q8QZZ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Rab38Q8QZZ8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rab38Q8QZZ8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Rab38Q8QZZ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rab38Q8QZZ8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Rab38Q8QZZ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rab38Q8QZZ8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rab38Q8QZZ8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rab38Q8QZZ8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rab38Q8QZZ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rab38Q8QZZ8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Rab38Q8QZZ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rab38Q8QZZ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Rab38Q8QZZ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rab38Q8QZZ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rab38Q8QZZ8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rab38Q8QZZ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Rab38Q8QZZ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,88
Rab38Q8QZZ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Rab38Q8QZZ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rab38Q8QZZ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rab38Q8QZZ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rab38Q8QZZ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Rab38Q8QZZ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rab38Q8QZZ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Rab38Q8QZZ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Rab38Q8QZZ8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rab38Q8QZZ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Rab38Q8QZZ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Rab38Q8QZZ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Rab38Q8QZZ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rab38Q8QZZ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rab38Q8QZZ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Rab38Q8QZZ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Rab38Q8QZZ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rab38Q8QZZ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rab38Q8QZZ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rab38Q8QZZ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Rab38Q8QZZ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rab38Q8QZZ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rab38Q8QZZ8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Rab38Q8QZZ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Rab38Q8QZZ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rab38Q8QZZ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rab38Q8QZZ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rab38Q8QZZ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rab38Q8QZZ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rab38Q8QZZ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rab38Q8QZZ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rab38Q8QZZ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rab38Q8QZZ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
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