RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 RNLSQ5VYX0 342 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 MORN4Q8NDC4 146 aa12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 ADAMTS15Q8TE58 950 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 C16orf58Q96GQ5 468 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 A6NCN8 305 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 UGT2B7P16662 529 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 PCYT1AP49585 367 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 ZNF91Q05481 1191 aa12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 ST3GAL3Q11203 375 aa12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 OR4K14Q8NGD5 310 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 C10orf90Q96M02 699 aa12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 OR2A14Q96R47 310 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 NTMQ9P121 344 aa12.85□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 CDH23Q9H251 3354 aa12.85□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 COL6A3P12111 3177 aa12.84□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 FAM221BA6H8Z2 402 aa12.84□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 SNTNA6NMZ2 147 aa12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 H0Y8X5 98 aa12.84□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 NDUFV2P19404 249 aa12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 MAGP20916 626 aa12.84□□□□□ -0.35
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THBS3-202ENST00000428962 CFL2Q9Y281 166 aa12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 KCNE3Q9Y6H6 103 aa12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 SPACA6W5XKT8 324 aa12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 A0A1W2PS29 197 aa12.83□□□□□ -0.35
THBS3-202ENST00000428962 AP3D1O14617 1153 aa12.83□□□□□ -0.35
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