RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 EHD3Q9NZN3 535 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC189A1A4V9 331 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3D21A4FU49 640 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 H0Y3Z8 333 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTFP26441 200 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CPA2P48052 419 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SRYQ05066 204 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A6Q6NXT4 461 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP54Q7Z3B4 507 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO25Q8TCJ0 367 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 G6PC3Q9BUM1 346 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 BRINP2Q9C0B6 783 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2B2Q9GZK3 357 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MAT2BQ9NZL9 334 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM29Q9UKF5 820 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CES1P1Q9UKY3 287 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 EXPH5Q8NEV8 1989 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A096LPK6 155 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2B11O75310 529 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL2O95198 593 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 RCBTB2O95199 551 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf54Q08AI8 447 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCXD2Q0VAA5 305 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TRADDQ15628 312 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GCNT2Q8N0V5 402 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 WDSUB1Q8N9V3 476 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 OR14L1PQ8NHC6 308 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 RDH11Q8TC12 318 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ISL2Q96A47 359 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TM9SF2Q99805 663 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRF1Q9NZS2 232 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAP29Q9UHQ4 241 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF639Q9UID6 485 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GCKP35557 465 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FEN1P39748 380 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP2Q05923 314 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP4K2Q12851 820 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TECRLQ5HYJ1 363 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FRG2Q64ET8 278 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC48A1Q6P1K1 146 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC24Q6UX98 284 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC9AQ6UXN8 241 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SMPDL3BQ92485 455 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1E2Q96A05 226 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP3Q96NJ6 502 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FRG2BQ96QU4 278 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCF1Q9UBD9 225 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CFL2Q9Y281 166 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PLLPQ9Y342 182 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MPDZO75970 2070 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK7Q96N67 2140 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF25A6NGN4 478 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CBX7O95931 251 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1B1P05026 303 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 STARP49675 285 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK12P53778 367 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GFRA1P56159 465 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF3Q13114 568 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SNTA1Q13424 505 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 KLC3Q6P597 504 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ENPP6Q6UWR7 440 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL4Q8N3J2 472 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY4Q8NFM4 1077 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT2BQ93097 391 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 UCN2Q96RP3 112 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOX3O15254 700 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CBR3O75828 277 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNG1P51959 295 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCY2DQ02846 1103 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SHEQ5VZ18 495 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PAGE2Q7Z2X7 111 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD6Q7Z4G1 85 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNEQ86WN2 208 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.28■■□□□ 1.32
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