RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TRABD2AQ86V40 505 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RDH11Q8TC12 318 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CCDC126Q96EE4 140 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GSTO2Q9H4Y5 243 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 WDR41Q9HAD4 459 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PROK2Q9HC23 129 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 DLL4Q9NR61 685 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SERTM1A2A2V5 107 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SNX4O95219 450 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GOSR1O95249 250 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GPR75O95800 540 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TUBBP07437 444 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 EPXP11678 715 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 KRT15P19012 456 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 KRT4P19013 534 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CCT5P48643 541 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NEK2P51955 445 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 WNT3P56703 355 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NRG3P56975 720 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 DNAJB13P59910 316 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NAA20P61599 178 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SORDQ00796 357 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TOMM20Q15388 145 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 BIVMQ86UB2 503 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PACS2Q86VP3 889 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RILPQ96NA2 401 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SERPINI1Q99574 410 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TIMP4Q99727 224 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 YIPF4Q9BSR8 244 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 BRF2Q9HAW0 419 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CAMK2AQ9UQM7 478 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ASB4Q9Y574 426 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NCKAP5O14513 1909 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GLOD5A6NK44 160 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TMPRSS11DO60235 418 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SUPT7LO94864 414 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 OR4F21O95013 312 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ATE1O95260 518 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 HSD3B1P14060 373 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TSPAN8P19075 237 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 HSD3B2P26439 372 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GALNSP34059 522 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GCKP35557 465 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ZNF136P52737 540 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PKNOX1P55347 436 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 FBXW4P57775 412 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 LCP2Q13094 533 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RCAN2Q14206 197 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NUDT13Q86X67 352 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 METTL4Q8N3J2 472 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 BANPQ8N9N5 519 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 DOK4Q8TEW6 326 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TP53INP1Q96A56 240 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 APOPT1Q96IL0 206 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TRIB1Q96RU8 372 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 OXSMQ9NWU1 459 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CD8B2A6NJW9 211 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SMIM23A6NLE4 172 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CLCA1A8K7I4 914 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 H3BQF6 201 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 COPEO14579 308 aa11.28□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ESRRBO95718 433 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms