RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exosc1Q9DAA6 195 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plekhb1Q9QYE9 243 aa20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppm1dQ9QZ67 598 aa20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm17190V9GX38 357 aa20.81■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cd300ld4A2A7W1 245 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm5072A2AHM1 344 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nxpe3B9EKK6 559 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1249L7MU51 318 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pcyt1aP49586 367 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ube2e3P52483 207 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc16a3P57787 470 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nt5eQ61503 576 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GnptgQ6S5C2 307 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AptxQ7TQC5 342 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psmd11Q8BG32 422 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clrn3Q8BHH8 226 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CptpQ8BS40 216 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf322Q8BZ89 410 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Uck2Q99PM9 261 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trappc5Q9CQA1 188 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PlgrktQ9D3P8 147 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sppl2aQ9JJF9 523 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A0A1W2P799 418 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1513L7N457 313 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P01667 111 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc7a2P18581 657 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zp2P20239 713 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stfa3P35173 103 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rps26P62855 115 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rps5P97461 204 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gsk3aQ2NL51 490 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Xkr9Q5GH62 373 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Snx6Q6P8X1 406 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr728Q7TRM6 311 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clec9aQ8BRU4 238 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gulp1Q8K2A1 304 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sh3bp4Q921I6 962 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Yaf2Q99LW6 179 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp4f15Q99N18 534 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc26a5Q99NH7 744 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trmt5Q9D0C4 501 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2010005H15RikQ9D8D6 97 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kcnj10Q9JM63 379 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tyk2Q9R117 1184 aa20.8■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ndor1A2AI05 598 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr544E9PX47 334 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rhox13F6YCR7 232 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm16506F7ANP4 213 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GzmeP08884 248 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 FurinP23188 793 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrpap1P55302 360 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem253Q3UNB8 204 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Foxs1Q61574 329 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tas2r13Q7M720 305 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gpr62Q80UC6 358 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Enpp6Q8BGN3 440 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CtsoQ8BM88 312 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gprin3Q8BWS5 763 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AcppQ8CE08 381 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem98Q91X86 226 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RragcQ99K70 398 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hspa14Q99M31 509 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cadm3Q99N28 396 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cxxc1Q9CWW7 660 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ube2fQ9CY34 185 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sema4gQ9WUH7 837 aa20.79■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm5141A0A0J9YUW3 581 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1032A2ATE5 310 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rnf217D3YYI7 515 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtprhE9Q0N2 971 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn1r16K7N775 303 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm17174M0QWQ9 212 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clk4O35493 481 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MgllO35678 303 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 JtbO88824 146 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 JupQ02257 745 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q8C0X8 640 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atat1Q8K341 421 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defb35Q8R2I3 63 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1414Q8VGU5 312 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prmt3Q922H1 532 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gtf2e2Q9D902 292 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zswim2Q9D9X6 631 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lpar3Q9EQ31 354 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Srebf1Q9WTN3 1134 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lzts3A2AHG0 700 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fgf18O89101 207 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MycP01108 439 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CatP24270 527 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rab33aP97950 237 aa20.78■□□□□ 0.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr384Q7TRX8 312 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.5 ms