Protein–RNA interactions for Protein: P24270

Cat, Catalase, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatP24270 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CatP24270 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CatP24270 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CatP24270 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CatP24270 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CatP24270 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CatP24270 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CatP24270 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CatP24270 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CatP24270 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CatP24270 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CatP24270 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CatP24270 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CatP24270 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CatP24270 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CatP24270 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CatP24270 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CatP24270 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CatP24270 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CatP24270 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CatP24270 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CatP24270 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CatP24270 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CatP24270 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CatP24270 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CatP24270 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CatP24270 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CatP24270 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CatP24270 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatP24270 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CatP24270 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CatP24270 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CatP24270 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CatP24270 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CatP24270 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CatP24270 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CatP24270 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CatP24270 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CatP24270 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CatP24270 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CatP24270 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CatP24270 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CatP24270 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CatP24270 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CatP24270 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CatP24270 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CatP24270 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CatP24270 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CatP24270 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CatP24270 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CatP24270 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CatP24270 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CatP24270 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatP24270 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CatP24270 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatP24270 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatP24270 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CatP24270 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CatP24270 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatP24270 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CatP24270 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CatP24270 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CatP24270 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CatP24270 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CatP24270 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CatP24270 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CatP24270 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CatP24270 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CatP24270 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CatP24270 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CatP24270 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CatP24270 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CatP24270 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CatP24270 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CatP24270 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatP24270 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CatP24270 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CatP24270 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CatP24270 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CatP24270 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CatP24270 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CatP24270 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CatP24270 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CatP24270 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CatP24270 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CatP24270 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CatP24270 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatP24270 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatP24270 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatP24270 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatP24270 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatP24270 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CatP24270 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CatP24270 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CatP24270 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CatP24270 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CatP24270 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CatP24270 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CatP24270 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CatP24270 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 324 ms